ControverSciences est archivé. Il reste consultable mais il n'est plus possible de contribuer.
Le code source pour faire tourner le serveur reste disponible sur GitHub.
Conservation des gènes liés au chromosome Y durant l'évolution de l'espèce humaine révélée par séquençage comparatif chez le chimpanzé.
Figure :
Dot-plot, comparaison de la région « dégénérée du X » du chromosome Y du chimpanzé (en bas) avec la région euchromatique du chromosome Y humain (à gauche). Ces régions chromosomiques sont montrée schématiquement sur les axes, ou les régions majeures sont indiquées. chaque point représente 100% de ressemblance dans une fenêtre de 200 paires de bases. les ombres grisées indiquent les arrêts d'alignement de séquence. les inversions sont marqués par les flèches (1,5Mb vert et 5Mb rouge)Conservation of Y-linked genes during human evolution revealed by comparative sequencing in chimpanzee
Introduction à l'article :
Les chimpanzés et les humains se sont différenciés il y a peu de temps dans l'histoire évolutive. Ainsi, ils partagent encore un grand nombre de gènes communs et leurs chromosomes sexuels (X et Y) partagent également un grand nombre de gènes. Ils possèdent également, en commun une région provenant de la dégénération de l'ancien chromosome X.
Concernant l'évolution des chromosomes sexuels, il est fortement recommandé de s'attaquer à l'article (Sex chromosome evolution: historical insights and future perspectives). Qui résume l'ensemble de l'évolution et des perspectives de l'étude des chromosomes sexuels.
Cet article s'intéresse à la conservation de gènes liés au chromosome Y humain par rapport à des gènes de la lignée du chimpanzé qui ont pu disparaître au cours de l'évolution. pour cela ils ont procédé à la comparaison entre la région que l'on appellera "dégénérée du X" provenant du chromosome Y du chimpanzé et la région euchromatique du chromosome Y humain.
Expériences de l'article :
Cartographie et séquençage de chromosomes bactériens artificiels provenant d'un mâle chimpanzé et de régions dégénérées du X du chromosome Y afin de séquencer et d'obtenir des sondes.
Séquençage complet de la séquence "dégénérée du X" du chimpanzé et comparaison avec les séquences du chromosome X humain afin de retrouver des séquences communes. De plus toutes les séquences connues ou prédites du chromosome X humain ont été comparées avec la région "dégénérée du X" du du Y du chimpanzé
Alignement de séquences avec Clustal W.
Assignation des évènements d'insertions et de délétions dans la lignée du chimpanzé ou humaine suite à l'alignement de l'ensemble des séquences.
Résultats de l'article :
Aucune séquence amplifiée et non identifiée comme des répétition entrecoupant le reste du chromosome n'a concordé avec des séquences du chromosome X humain mais 97% d'entre elles correspondaient à des séquences "dégénérées du X", 99% de ces séquences étaient réellement identiques et étaient présumé "provenant du X"
Il n'y a aucune séquence absente du chromosome Y humain significativement concordante entre le X humain et les "dégénérées du X" du chimpanzé.
Au moins 100 insertions ou délétions repérées lorsque les séquences "dégénérées du X" humain et du chimpanzé ont été alignées.
Ce que cet article apporte au débat :
Cet article pointe le fait que les séquences "dégénérées du X" présentes dans la lignée du chimpanzé ont diminué en taille au cours du temps mais pas dans la lignée humaine. Il acte en faveur d'une non-disparition du chromosome Y chez l'Homme car celui-ci ne semble pas avoir perdu de gènes majeurs ou de séquences par rapport au génotype du chimpanzé.
Conservation des gènes liés au chromosome Y durant l'évolution de l'espèce humaine révélée par séquençage comparatif chez le chimpanzé.
Dot-plot, comparaison de la région « dégénérée du X » du chromosome Y du chimpanzé (en bas) avec la région euchromatique du chromosome Y humain (à gauche). Ces régions chromosomiques sont montrée schématiquement sur les axes, ou les régions majeures sont indiquées. chaque point représente 100% de ressemblance dans une fenêtre de 200 paires de bases. les ombres grisées indiquent les arrêts d'alignement de séquence. les inversions sont marqués par les flèches (1,5Mb vert et 5Mb rouge)Conservation of Y-linked genes during human evolution revealed by comparative sequencing in chimpanzee
Les chimpanzés et les humains se sont différenciés il y a peu de temps dans l'histoire évolutive. Ainsi, ils partagent encore un grand nombre de gènes communs et leurs chromosomes sexuels (X et Y) partagent également un grand nombre de gènes. Ils possèdent également, en commun une région provenant de la dégénération de l'ancien chromosome X.
Concernant l'évolution des chromosomes sexuels, il est fortement recommandé de s'attaquer à l'article (Sex chromosome evolution: historical insights and future perspectives). Qui résume l'ensemble de l'évolution et des perspectives de l'étude des chromosomes sexuels.
Cet article s'intéresse à la conservation de gènes liés au chromosome Y humain par rapport à des gènes de la lignée du chimpanzé qui ont pu disparaître au cours de l'évolution. pour cela ils ont procédé à la comparaison entre la région que l'on appellera "dégénérée du X" provenant du chromosome Y du chimpanzé et la région euchromatique du chromosome Y humain.
Cartographie et séquençage de chromosomes bactériens artificiels provenant d'un mâle chimpanzé et de régions dégénérées du X du chromosome Y afin de séquencer et d'obtenir des sondes.
Séquençage complet de la séquence "dégénérée du X" du chimpanzé et comparaison avec les séquences du chromosome X humain afin de retrouver des séquences communes. De plus toutes les séquences connues ou prédites du chromosome X humain ont été comparées avec la région "dégénérée du X" du du Y du chimpanzé
Alignement de séquences avec Clustal W.
Assignation des évènements d'insertions et de délétions dans la lignée du chimpanzé ou humaine suite à l'alignement de l'ensemble des séquences.
Aucune séquence amplifiée et non identifiée comme des répétition entrecoupant le reste du chromosome n'a concordé avec des séquences du chromosome X humain mais 97% d'entre elles correspondaient à des séquences "dégénérées du X", 99% de ces séquences étaient réellement identiques et étaient présumé "provenant du X"
Il n'y a aucune séquence absente du chromosome Y humain significativement concordante entre le X humain et les "dégénérées du X" du chimpanzé.
Au moins 100 insertions ou délétions repérées lorsque les séquences "dégénérées du X" humain et du chimpanzé ont été alignées.
Cet article pointe le fait que les séquences "dégénérées du X" présentes dans la lignée du chimpanzé ont diminué en taille au cours du temps mais pas dans la lignée humaine. Il acte en faveur d'une non-disparition du chromosome Y chez l'Homme car celui-ci ne semble pas avoir perdu de gènes majeurs ou de séquences par rapport au génotype du chimpanzé.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.