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La diversification des mammifères placentaires et la limite du Crétacé-Tertiaire
Introduction à l'article :
Il existe trois hypothèses de diversification des mammifères placentaires, par rapport à la crise du Crétacé-Paléogène :
Le modèle explosif ("Explosive model"), qui propose une origine et diversification inter et intra-ordinale post K-Pg, et est soutenu par le registre fossile
Le modèle "short fuse", qui place ces trois événements pendant le Crétacé
Le modèle "long fuse", qui place l'origine des placentaires ainsi que l'apparition des ordres actuels avant la crise, mais les diversifications au sein des ordres ayant eu lieu pour la majorité après l'extinction de masse
Les analyses se basant sur les données moléculaires favorisent les deux derniers, mais présentent le problème de ne pas se baser sur suffisamment de calibrations fossiles, et d'utiliser des hypothèses erronées d'évolution moléculaire.
Expériences de l'article :
Les chercheurs utilisent pour cette étude la plus grande base de données moléculaires, utilisée dans une étude précédente de Murphy et al. (2001), ainsi que plusieurs calibrations fossiles, et des nouvelles approches bayésiennes, pour estimer les temps de divergence des différents clades. La base de données regroupe un alignement de plus de 16000 nucléotides, dont 19 gènes nucléaires et 3 gènes mitochondriaux, de 42 mammifères placentaires.
Ils génèrent des analyses sur les données entières, des partitions, avec des priors différents pour la racine des placentaires, et des groupes externes différents, en contraignant les arbres grâce à des calibrations fossiles, et en permettant que les taux d'évolution soient variables sur les différentes branches. Ils utilisent le modèle d'évolution des séquences de Felsenstein (taux variables entre taxons), et estiment les âges de divergence grâce à DIVTIME5B avec 3 priors différents pour la racine des placentaires.
Résultats de l'article :
Globalement, leurs résultats sont très similaires peu importe le mode de partitionnement des données, le groupe externe ou les calibrations utilisées. Ils montrent une origine des placentaires pré K-Pg, entre 97 et 112 Ma. L'apparition des divers ordres actuels semble avoir lieu pendant le Crétacé, même si certains apparaissent peu de temps avant la crise. Pour la majorité, les diversifications au sein des différents ordres ont lieu après la crise.
Ce que cet article apporte au débat :
Ces résultats semblent tendre en faveur du modèle "long fuse", avec une légère modification. Les diversifications au sein des ordres commencent au Crétacé et se poursuivent pendant et après la crise.
Remarques sur l'article :
Ils montrent aussi qu'en prenant un sous jeu de données contenant uniquement des taxons de petite taille, comme semblait l'être l'ancêtre commun des mammifères, les résultats pour les temps de divergence sont assez similaires.
Publiée il y a plus de 7 ans
par
I. Voet et A. Stahl.
Dernière modification il y a plus de 7 ans.
La diversification des mammifères placentaires et la limite du Crétacé-Tertiaire
Introduction à l'article :
Il existe trois hypothèses de diversification des mammifères placentaires, par rapport à la crise du Crétacé-Paléogène :
Les chercheurs utilisent pour cette étude la plus grande base de données moléculaires, utilisée dans une étude précédente de Murphy et al. (2001), ainsi que plusieurs calibrations fossiles, et des nouvelles approches bayésiennes, pour estimer les temps de divergence des différents clades. La base de données regroupe un alignement de plus de 16000 nucléotides, dont 19 gènes nucléaires et 3 gènes mitochondriaux, de 42 mammifères placentaires.
Ils génèrent des analyses sur les données entières, des partitions, avec des priors différents pour la racine des placentaires, et des groupes externes différents, en contraignant les arbres grâce à des calibrations fossiles, et en permettant que les taux d'évolution soient variables sur les différentes branches. Ils utilisent le modèle d'évolution des séquences de Felsenstein (taux variables entre taxons), et estiment les âges de divergence grâce à DIVTIME5B avec 3 priors différents pour la racine des placentaires.
Globalement, leurs résultats sont très similaires peu importe le mode de partitionnement des données, le groupe externe ou les calibrations utilisées. Ils montrent une origine des placentaires pré K-Pg, entre 97 et 112 Ma. L'apparition des divers ordres actuels semble avoir lieu pendant le Crétacé, même si certains apparaissent peu de temps avant la crise. Pour la majorité, les diversifications au sein des différents ordres ont lieu après la crise.
Ces résultats semblent tendre en faveur du modèle "long fuse", avec une légère modification. Les diversifications au sein des ordres commencent au Crétacé et se poursuivent pendant et après la crise.
Ils montrent aussi qu'en prenant un sous jeu de données contenant uniquement des taxons de petite taille, comme semblait l'être l'ancêtre commun des mammifères, les résultats pour les temps de divergence sont assez similaires.
Dernière modification il y a plus de 7 ans.