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L'origine des serpents : révéler l'écologie, le comportement et l'histoire évolutive des premiers serpents en utilisant la génomique, la phénomique et les archives fossiles
Figure :
Reconstruction de l'ancêtre commun de Serpentes, basé sur cette étude. Illustration par Julius Csotonyi.
Introduction à l'article :
Les auteurs de l'article construisent quatre phylogénies différentes qui décrivent les positions des serpents au sein des squamates. A partir de ces différentes phylogénies ils reconstruisent les caractères ancestraux du groupe complet des serpents (Pan-serpentes, qui inclut les fossiles les plus anciens) et du clade Serpentes qui regroupe seulement les Scolecophidiens et les Alethinophidiens. Grâce à la reconstruction des états ancestraux, les auteurs sont capables d'inférer l'écologie, le comportement et l'origine géographique des deux ancêtres des clades Pan-serpentes et Serpentes. De plus, ils infèrent le temps de divergence des deux groupes. Ainsi, ils révèlent une image très claire du début de l'évolution des serpents, en mettant à la lumière leurs origines écologique, comportementale, biogéographique et macroévolutive.
Expériences de l'article :
Les auteurs reconstruisent quatre arbres phylogénétiques à partir de: 1) données phénotypiques, 2) données génétiques, 3) données phénotypiques et génétiques combinées, sans contraintes topologiques et 4) données phénotypiques et génétiques combinées, avec des contraintes topologiques. Ensuite ils réalisent une reconstruction de 11 caractères ancestraux grâce à différents cadres de travail : parcimonie, maximum de vraissemblance et bayésien. Ceci pour les ancêtres communs les plus récents des groupes Pan-serpentes et Serpentes. De plus, une reconstruction biogéographique est réalisée grâce à la méthode biogéographique "Lagrange". Enfin, ils estiment les temps de divergence en utilisant les arbres phylogénétiques 2,3 et 4.
Résultats de l'article :
Les deux ancêtres de Pan-serpentes et Serpentes ont été reconstruits sans ambiguïté par toutes les méthodes et dans tous les arbres comme des serpents terrestres, ce qui supporte l'hypothèse que les serpents sont apparus sur terre plutôt que dans la mer. De plus, l'inférence sur les habitudes ne permet pas de différencier entre fouisseur et terrestre strict, et les deux sont donc possibles. Les deux ancêtres communs ont été inférés comme des serpents vivant dans des environnements chauds, humides et comprenant beaucoup de végétation (tropicaux ou subtropicaux). Ils étaient nocturnes et probablement des prédateurs furtifs largement à la recherche de nourriture, chassant des proies légères de taille inférieure à leur tête.
Les auteurs montrent une provenance de Pan-serpentes en Laurasie il y a environ 128.5 Ma et une provenance du Gondwana pour Serpentes il y a environ 110.3 Ma.
Rigueur de l'article :
L'article est très rigoureux dans la manière de procéder, et représente beaucoup de travail pour aboutir à ces conclusions. Les nombreuses incertitudes au niveau des inférences ne peuvent être attribuées que à un manque d'information au niveau des fossiles et à certaines méthodes comme "Lagrange" qui ont du mal à donner des résultats non-ambigus. Pour le reste il semble que leurs inférences tiennent la route.
Ce que cet article apporte au débat :
Cet article apporte au débat une vision assez claire de l'origine, le mode de vie et le comportement de l'ancêtre commun des serpents. Il supporte l'hypothèse terrestre de l'origine écologique des serpents, avec des habitudes semi-fouisseuses et une stratégie de chasse semblable à celle des serpents contemporains.
L'origine des serpents : révéler l'écologie, le comportement et l'histoire évolutive des premiers serpents en utilisant la génomique, la phénomique et les archives fossiles
Reconstruction de l'ancêtre commun de Serpentes, basé sur cette étude. Illustration par Julius Csotonyi.
Les auteurs de l'article construisent quatre phylogénies différentes qui décrivent les positions des serpents au sein des squamates. A partir de ces différentes phylogénies ils reconstruisent les caractères ancestraux du groupe complet des serpents (Pan-serpentes, qui inclut les fossiles les plus anciens) et du clade Serpentes qui regroupe seulement les Scolecophidiens et les Alethinophidiens. Grâce à la reconstruction des états ancestraux, les auteurs sont capables d'inférer l'écologie, le comportement et l'origine géographique des deux ancêtres des clades Pan-serpentes et Serpentes. De plus, ils infèrent le temps de divergence des deux groupes. Ainsi, ils révèlent une image très claire du début de l'évolution des serpents, en mettant à la lumière leurs origines écologique, comportementale, biogéographique et macroévolutive.
Les auteurs reconstruisent quatre arbres phylogénétiques à partir de: 1) données phénotypiques, 2) données génétiques, 3) données phénotypiques et génétiques combinées, sans contraintes topologiques et 4) données phénotypiques et génétiques combinées, avec des contraintes topologiques. Ensuite ils réalisent une reconstruction de 11 caractères ancestraux grâce à différents cadres de travail : parcimonie, maximum de vraissemblance et bayésien. Ceci pour les ancêtres communs les plus récents des groupes Pan-serpentes et Serpentes. De plus, une reconstruction biogéographique est réalisée grâce à la méthode biogéographique "Lagrange". Enfin, ils estiment les temps de divergence en utilisant les arbres phylogénétiques 2,3 et 4.
Les deux ancêtres de Pan-serpentes et Serpentes ont été reconstruits sans ambiguïté par toutes les méthodes et dans tous les arbres comme des serpents terrestres, ce qui supporte l'hypothèse que les serpents sont apparus sur terre plutôt que dans la mer. De plus, l'inférence sur les habitudes ne permet pas de différencier entre fouisseur et terrestre strict, et les deux sont donc possibles. Les deux ancêtres communs ont été inférés comme des serpents vivant dans des environnements chauds, humides et comprenant beaucoup de végétation (tropicaux ou subtropicaux). Ils étaient nocturnes et probablement des prédateurs furtifs largement à la recherche de nourriture, chassant des proies légères de taille inférieure à leur tête.
Les auteurs montrent une provenance de Pan-serpentes en Laurasie il y a environ 128.5 Ma et une provenance du Gondwana pour Serpentes il y a environ 110.3 Ma.
L'article est très rigoureux dans la manière de procéder, et représente beaucoup de travail pour aboutir à ces conclusions. Les nombreuses incertitudes au niveau des inférences ne peuvent être attribuées que à un manque d'information au niveau des fossiles et à certaines méthodes comme "Lagrange" qui ont du mal à donner des résultats non-ambigus. Pour le reste il semble que leurs inférences tiennent la route.
Cet article apporte au débat une vision assez claire de l'origine, le mode de vie et le comportement de l'ancêtre commun des serpents. Il supporte l'hypothèse terrestre de l'origine écologique des serpents, avec des habitudes semi-fouisseuses et une stratégie de chasse semblable à celle des serpents contemporains.
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