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Les génomes des tortues géantes apportent des indices sur la longévité et les maladies liées à l'âge
Introduction à l'article :
L'analyse comparative des génomes permet la caractérisation de l'évolution des gènes. Cette approche peut mettre en évidence des déterminants génétiques impliquées dans la sénescence chez des animaux à longue durée de vie. Les tortues sont des modèles intéressants pour ce genre d'étude, tant leur espérance de vie est élevée.
Expériences de l'article :
Les génomes de divers représentants d'espèces de tortues ont été séquencés puis ont été comparés après annotation fonctionnelle des gènes (RANseq + ADNseq). Une phylogénie a été construite et l'évolution des populations a été modélisé. La signature de sélection évolutive des gènes a aussi été analysée.
L'objectif a été de mettre en évidence des gènes différentiellement fonctionnels et abondants parmi diverses espèces de tortues et en comparaison à d'autres reptiles ou à des mammifères.
Résultats de l'article :
-Prédiction de 43 gènes positivement sélectionnés : AHSG et FGF19 (régulation du métabolisme - favorise la durée de vie humaine) ; TDO2 (protection contre les maladies liées à l'âge) ; MVK, IRAK1BP1 et IL1R2 (modulation de la réponse immunitaire)
Identification de 100 variants de gènes du métabolisme, l'immunité, la suceptibilité au cancer, la réponse au stress et la longévité
-Gènes de l'immunité : caractérisation de l'expansion du gène PRF1 (perforine) chez les tortues (12 copies contre 1 chez les mammifères) ; expansion du locus chymase et de gènes de défense contre pathogènes (immunité innée)
-Variant facilite l'utilisation du glucose - Régulation négative de la sensation de nutriments - altération de la voie insulin/IGF
-Gènes variants dans la réponse au stress (hypoxie et DNA repair)
-Expansion de gènes suppresseurs de tumeurs (+ immunosurveillance PRF1)
-Durée de vie : duplication de gènes de réparation de l'ADN - conservation des télomères
-Variants altérant la communication inter-cellulaire
Ce que cet article apporte au débat :
L'analyse de l'abondance et de la fonctionnalité des gènes chez les tortues géantes à longue durée de vie conforte les études portant sur le vieillissement. En effet, les marqueurs liés à l'âge déjà connus sont retrouvé dupliqués (pour ceux favorisant la durée de vie) ou altérés (pour ceux défavorisant) chez les tortues. En particulier, la voie IGF/insuline est atténuée chez les tortues. Enfin, les gènes de réparations de l'ADN et de réponse au stress sont dupliqués, de même que les gènes de l'immunité. Chez ces organismes, la durée de vie est favorisé par le contrôle des maladies et par la maintien de l'intégrité cellulaire.
Les tortues géantes ont la caractéristique de posséder un métabolisme lent et une reproduction très faible. Il semble que l'évolution ait sélectionné la durée de vie au profit de la reproduction chez ces espèces.
Remarques sur l'article :
Les données sont en résultats supplémentaires et sont très conséquentes. Les explications entre les duplications ou les altérations de gènes et les conséquences sur le métabolisme ne sont pas explicites.
Publiée il y a plus de 7 ans
par
B. Taillefer.
Dernière modification il y a plus de 7 ans.
Les génomes des tortues géantes apportent des indices sur la longévité et les maladies liées à l'âge
Introduction à l'article :
L'analyse comparative des génomes permet la caractérisation de l'évolution des gènes. Cette approche peut mettre en évidence des déterminants génétiques impliquées dans la sénescence chez des animaux à longue durée de vie. Les tortues sont des modèles intéressants pour ce genre d'étude, tant leur espérance de vie est élevée.
Les génomes de divers représentants d'espèces de tortues ont été séquencés puis ont été comparés après annotation fonctionnelle des gènes (RANseq + ADNseq). Une phylogénie a été construite et l'évolution des populations a été modélisé. La signature de sélection évolutive des gènes a aussi été analysée.
L'objectif a été de mettre en évidence des gènes différentiellement fonctionnels et abondants parmi diverses espèces de tortues et en comparaison à d'autres reptiles ou à des mammifères.
-Prédiction de 43 gènes positivement sélectionnés : AHSG et FGF19 (régulation du métabolisme - favorise la durée de vie humaine) ; TDO2 (protection contre les maladies liées à l'âge) ; MVK, IRAK1BP1 et IL1R2 (modulation de la réponse immunitaire)
L'analyse de l'abondance et de la fonctionnalité des gènes chez les tortues géantes à longue durée de vie conforte les études portant sur le vieillissement. En effet, les marqueurs liés à l'âge déjà connus sont retrouvé dupliqués (pour ceux favorisant la durée de vie) ou altérés (pour ceux défavorisant) chez les tortues. En particulier, la voie IGF/insuline est atténuée chez les tortues. Enfin, les gènes de réparations de l'ADN et de réponse au stress sont dupliqués, de même que les gènes de l'immunité. Chez ces organismes, la durée de vie est favorisé par le contrôle des maladies et par la maintien de l'intégrité cellulaire.
Les tortues géantes ont la caractéristique de posséder un métabolisme lent et une reproduction très faible. Il semble que l'évolution ait sélectionné la durée de vie au profit de la reproduction chez ces espèces.
Les données sont en résultats supplémentaires et sont très conséquentes. Les explications entre les duplications ou les altérations de gènes et les conséquences sur le métabolisme ne sont pas explicites.
Dernière modification il y a plus de 7 ans.