Les serpents ont évolué à partir des lézards mais leurs yeux sont sensiblement différents aujourd'hui. Les caractères de ces derniers sont généralement associés à une écologie fouisseuse et nocturne des serpents. Mais ils ont également des points communs avec des taxons aquatiques. Les auteurs proposent donc de faire un analyse poussée par comparaison aux sein de nombreux taxons, l'anatomie des yeux en fonction de différents caractères afin de regrouper les taxons suivant une écologie commune et non une phylogénie.

Une matrice contenant 69 caractères ophtalmiques ou orbitaux de 53 taxons de vertébrés récupérés dans la littérature scientifique a été utilisée afin de mettre en évidence des relations entre différents taxons à l'aide d'une analyse de parcimonie et phénétique. Suite à cela, la matrice a été transformée en matrice binaire permettant de calculer la distance de similarité (nombre de caractères partagés) sur les serpents basaux (Scolecophidia) et le groupe principal (Alethinophidia) suivant les autres taxons. Ceci permettant d'observer plus précisément les relations entre ces 2 groupes de serpents et des autres taxons étudiés.

L'arbre créé rapproche les taxons ayant une écologie similaire plutôt que par leur relation phylogénétique. 3 caractères ont rapproché les serpents avec des taxons aquatiques (poissons et certains amphibiens) : la présence d'une cornée aplatie, une marge cornéenne épaisse et un cristallin sphérique. Le calcul des distances de similarité entre les 2 groupes de serpents permet de mettre en lumière un partage de nombreux caractères entre le groupe des serpents (Alethinophidia) et des taxons aquatiques comme les requins, les baleines, les siréniens, certains poissons et les lamproies. Concernant le groupe des Scolecophidia, ils se rapprochent plus des taxons comme les amphibiens sans membres, certains poissons, les souris, les siréniens et les échidnés. Ainsi, selon les auteurs, les yeux des serpents ont plus de caractères en commun avec des taxons aquatiques que des taxons fouisseurs. L'origine écologique des serpents semble alors être plus proche d'une origine aquatique que terrestre.

Malgré les différentes relations nouvellement créées (rapprochement des taxons aquatiques avec les serpents), le taxon le plus proche des principaux serpents dits "non-primitifs" (Alethinophidia) est celui des Scolecophidia, un groupe basal de serpents fouisseurs possédant des yeux réduits. De plus, le fait de rapprocher les organismes selon leur écologie peut fausser les interprétations sur l'origine écologique d'un groupe car c'est un état des lieux actuel et de nombreuses analogies provenant d'évolutions différentes sont faites dans ce papier (exemple, rapprochement des requins et des serpents).

Les auteurs amènent une vision différente au sujet de l'anatomie des yeux de serpents. Etant à l'origine, un indice sur le caractère ancestral terrestre, cette étude relance le débat sur l'association de l'anatomie des yeux avec une origine terrestre ou aquatique.