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Structure génétique des populations urbaines et rurales d'Apodemus agrarius en Pologne
Introduction à l'article :
Les effets de la fragmentation de l'habitat sur les populations peut influencer la dynamique écologique, incluant la différenciation génétique. Les espèces subissent des changements adaptatifs menant à la formation de nouveaux comportements ou à une différenciation génétique due à la dérive génétique par une isolation ou à la sélection par un milieu avec des conditions divergentes.
Expériences de l'article :
La ville de Warsaw en Pologne est prise pour déterminer les zones urbaines tandis que les alentours du Lac Mazurian sont pour les zones rurales. 5 aires sont choisies dans la ville avec différents degrés de pression humaine : U1-U3 des parcs dont U3 est le plus près du centre ville, U2 au bord de la ville proche d'aires cultivées; U4 et U5 dans des complexes de lotissements.
6 aires sont choisies autour du lac, R1-R4 dans un bois d'aulnes, R5 et R6 dans des fourrés de saules. Dans la zone urbaine, le paysage permet le mouvement libre des campagnols entre les aires.
A chaque endroit, on les capture dans des pièges avec deux pièges par sites sur 25 sites. La date de capture et le lieu de la capture sont notés et les individus capturés pour la première fois sont marqués avec un numéro individuel. Un fragment de peau est prélevé pour les études de génétique à chaque première capture.
Sur 269 individus et avec 8 locus microsatellites, des études de génétique des populations sont réalisées.
Résultats de l'article :
L'hétérozygotie entre les populations urbaines et rurales est similaire.
Il y a de grandes valeurs de différenciation génétique (Fst) dans la population urbaine.
Les comparaisons par paire de Fst entre les deux populations sont significatives pour la majorité.
Les plus fortes valeurs différenciations sont entre les individus des aires U3 et U4 avec les individus de la zone rurale.
La plus petite valeur de différenciation est celle des individus de l'aire U2.
Pas de significativité d'isolement par la distance pour la population rurale.
Dans la population urbaine,
Les aires les plus différenciées génétiquement sont les U3 et U5, proches dans le centre ville mais séparées par des immeubles et des routes très fréquentées.
Le deltaK (de Evanno) montre un clustering de la population urbaine en 3 clusters alors que la population rurale n'en forme qu'un.
U5 est l'aire la plus différenciée, U4 est partagée en 2 clusters (clust 2 et 3) et U2 est majoritairement dans le cluster "rural".
Ce que cet article apporte au débat :
A l'intérieur de la ville, le milieu est fortement fragmenté. La population urbaine est fragmentée en populations isolées par le manque d'échange de gènes. L'exploitation de la ville induit chez certaines espèces une différenciation des populations par rapport à la population dans le milieu rural par dérive génétique.
Publiée il y a plus de 6 ans
par
E. Conte.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.
Structure génétique des populations urbaines et rurales d'Apodemus agrarius en Pologne
Introduction à l'article :
Les effets de la fragmentation de l'habitat sur les populations peut influencer la dynamique écologique, incluant la différenciation génétique. Les espèces subissent des changements adaptatifs menant à la formation de nouveaux comportements ou à une différenciation génétique due à la dérive génétique par une isolation ou à la sélection par un milieu avec des conditions divergentes.
La ville de Warsaw en Pologne est prise pour déterminer les zones urbaines tandis que les alentours du Lac Mazurian sont pour les zones rurales. 5 aires sont choisies dans la ville avec différents degrés de pression humaine : U1-U3 des parcs dont U3 est le plus près du centre ville, U2 au bord de la ville proche d'aires cultivées; U4 et U5 dans des complexes de lotissements.
6 aires sont choisies autour du lac, R1-R4 dans un bois d'aulnes, R5 et R6 dans des fourrés de saules. Dans la zone urbaine, le paysage permet le mouvement libre des campagnols entre les aires.
A chaque endroit, on les capture dans des pièges avec deux pièges par sites sur 25 sites. La date de capture et le lieu de la capture sont notés et les individus capturés pour la première fois sont marqués avec un numéro individuel. Un fragment de peau est prélevé pour les études de génétique à chaque première capture.
Sur 269 individus et avec 8 locus microsatellites, des études de génétique des populations sont réalisées.
Dans la population urbaine,
Les aires les plus différenciées génétiquement sont les U3 et U5, proches dans le centre ville mais séparées par des immeubles et des routes très fréquentées.
Le deltaK (de Evanno) montre un clustering de la population urbaine en 3 clusters alors que la population rurale n'en forme qu'un.
U5 est l'aire la plus différenciée, U4 est partagée en 2 clusters (clust 2 et 3) et U2 est majoritairement dans le cluster "rural".
A l'intérieur de la ville, le milieu est fortement fragmenté. La population urbaine est fragmentée en populations isolées par le manque d'échange de gènes. L'exploitation de la ville induit chez certaines espèces une différenciation des populations par rapport à la population dans le milieu rural par dérive génétique.
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