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Diversité génétique d'une population de plante herbacée clonale Linaria vulgaris auto-incompatible le long d'un gradient d'urbanisation
Introduction à l'article :
Tous comme les animaux les plantes aussi peuvent être affectées par l'urbanisation. L'étude de cet article est menée le long d'un gradient d'urbanisation et cherche à évaluer l'impact génétique de l'urbanisation et la fragmentation de l'habitat sur la population de Linaria vulgaris une plante capable de se reproduire par clonage.
Le degré d'urbanisation est-il corrélé négativement à la taille de la population et au niveau de diversité génétique et clonale?
Comment la diversité génétique est-elle structurée au sein des populations et entre elles?
Dans quelle mesure la taille de la population et le degré de diversité clonale sont-ils liés au semis?
Expériences de l'article :
Etude menée sur 23 populations de Linaria vulgaris dans la ville de Louvain (Allemagne) sur un secteur de 200 km2.
Prélèvement de feuilles sur chaque population pour des analyses ADN. L'ADN extrait a été amplifié à l'aide d'une PCR. L'analyse du nombre de génotypes multilocus a été effectués avec sept marqueurs microsatellites.
Une analyse en coordonnées principales standardisées a été réalisé pour connaitre la distribution de la variation génétique dans les populations.
Des prélèvements de semences ont aussi été faite pour connaitre la diversité clonale et la richesse clonale, et servi d'indicateur indirect de la taille des populations.
Au total, 470 individus ont été génotypés à partir des sept marqueurs microsatellites, ce qui a donné 64 allèles microsatellites et 181 génotypes multilocus différents.
Estimation de l'urbanisation à partir du pourcentage de surfaces imperméables comme indicateur indirect de l'urbanisation avec le logiciel QGIS.
Résultats de l'article :
Populations d'études diversité allélique et génotypique très variable. Diversité clonale diminue avec l'augmentation de l'urbanisation et la diminution de la taille des populations, plus le degré d’urbanisme augmente plus les génotypes non adaptés à l’urbanisme disparaissent, diminuant le réservoir génétique et le nombre de partenaires possible. Donc plus les populations ont peu de génotypes, plus la diversité allélique est faible et moins il y a de graine (dispersion des graines limitées chez L. vulgaris). Diminution de la diversité clonale est aussi aggraver par une pollinisation et un flux de gène réduit dans les populations les plus urbanisées, en raison du manque de pollinisateurs en déclin. Dérive génétique plus prononcée chez les espèces auto-incompatibles et probablement accentuée par l’urbanisation.
La réduction de la taille de la population et l'urbanisation agissent ensemble, diminuant la diversité clonale de L. vulgaris, est limitant sa capacité à se reproduire sexuellement.
Rigueur de l'article :
Les auteurs ne précisent pas quel type de marqueur microsatellite ils ont utilisé. Il manque des explications pour les abréviations.
Ce que cet article apporte au débat :
Cet article montre que les plantes aussi sont impactées par l'urbanisation et la fragmentation de leur habitat. Cependant ici l’urbanisation accentue les divergences génétiques entre les populations, qui sont déjà importantes chez les petites populations d'espèces auto-incompatibles provoquées par dérive génétique qu'elles soient urbaines ou non urbaines. Ici l'urbanisation est négative pour ces espèces car elle diminue leur possibilité de se reproduire sexuellement.
Publiée il y a plus de 6 ans
par
L. Amary.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.
Diversité génétique d'une population de plante herbacée clonale Linaria vulgaris auto-incompatible le long d'un gradient d'urbanisation
Introduction à l'article :
Tous comme les animaux les plantes aussi peuvent être affectées par l'urbanisation. L'étude de cet article est menée le long d'un gradient d'urbanisation et cherche à évaluer l'impact génétique de l'urbanisation et la fragmentation de l'habitat sur la population de Linaria vulgaris une plante capable de se reproduire par clonage.
Etude menée sur 23 populations de Linaria vulgaris dans la ville de Louvain (Allemagne) sur un secteur de 200 km2.
Prélèvement de feuilles sur chaque population pour des analyses ADN. L'ADN extrait a été amplifié à l'aide d'une PCR. L'analyse du nombre de génotypes multilocus a été effectués avec sept marqueurs microsatellites.
Une analyse en coordonnées principales standardisées a été réalisé pour connaitre la distribution de la variation génétique dans les populations.
Des prélèvements de semences ont aussi été faite pour connaitre la diversité clonale et la richesse clonale, et servi d'indicateur indirect de la taille des populations.
Au total, 470 individus ont été génotypés à partir des sept marqueurs microsatellites, ce qui a donné 64 allèles microsatellites et 181 génotypes multilocus différents.
Estimation de l'urbanisation à partir du pourcentage de surfaces imperméables comme indicateur indirect de l'urbanisation avec le logiciel QGIS.
Populations d'études diversité allélique et génotypique très variable. Diversité clonale diminue avec l'augmentation de l'urbanisation et la diminution de la taille des populations, plus le degré d’urbanisme augmente plus les génotypes non adaptés à l’urbanisme disparaissent, diminuant le réservoir génétique et le nombre de partenaires possible. Donc plus les populations ont peu de génotypes, plus la diversité allélique est faible et moins il y a de graine (dispersion des graines limitées chez L. vulgaris). Diminution de la diversité clonale est aussi aggraver par une pollinisation et un flux de gène réduit dans les populations les plus urbanisées, en raison du manque de pollinisateurs en déclin. Dérive génétique plus prononcée chez les espèces auto-incompatibles et probablement accentuée par l’urbanisation.
La réduction de la taille de la population et l'urbanisation agissent ensemble, diminuant la diversité clonale de L. vulgaris, est limitant sa capacité à se reproduire sexuellement.
Les auteurs ne précisent pas quel type de marqueur microsatellite ils ont utilisé. Il manque des explications pour les abréviations.
Cet article montre que les plantes aussi sont impactées par l'urbanisation et la fragmentation de leur habitat. Cependant ici l’urbanisation accentue les divergences génétiques entre les populations, qui sont déjà importantes chez les petites populations d'espèces auto-incompatibles provoquées par dérive génétique qu'elles soient urbaines ou non urbaines. Ici l'urbanisation est négative pour ces espèces car elle diminue leur possibilité de se reproduire sexuellement.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.