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Préservation des sols et du carbone du sol par le biais de contraintes d'habitat et de limitations biologiques de l'activité des décomposeurs
Résumé de la review :
L'apport en carbone provient principalement de la litière de feuilles, de la litière de racines et des exsudats de racines. Environ 85 à 90 % de la décomposition des matières organiques (MO) dans le sol se fait par voie microbienne et environ 10 à 15 % de l'énergie produite est utilisée par la faune du sol.
La revu montre que les organismes du sol ont des préférences pour différents substrats et se localisent dans différents espaces pédologiques.
La localisation des microorganismes a montré qu'elle n'était pas en adéquation avec la disponibilité en substrat C.
Les champignons assimilent le C directement de la couche de litière, tandis que les bactéries absorbent les substrats du sol sous la litière. L'étendue et l'intensité de la zone active de décomposition bactérienne sont directement liées au transport du soluté par diffusion et convection. L'augmentation de la teneur en eau accélère le transport des substrats solubles, ce qui entraîne une augmentation de la biomasse et de l'activité microbienne, tout en entraînant un épuisement plus rapide des substrats pour la croissance et l'activité microbiennes après la phase initiale. Il semble donc que la décomposition bactérienne des substrats à faible poids moléculaire dépendent de l'efficacité de l'échelle microscopique transport à proximité des populations bactériennes.
Les organismes autotrophes utilisent l'énergie obtenue de la lumière ou de composés inorganiques pour réduire le CO2 et synthétiser la MO. Bien que d'autres voies métaboliques existent, le cycle de Calvin est de loin la voie de fixation du CO2 la plus abondante avec la ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygénase (Rubisco) comme enzyme fixant le CO2. Outre les organismes eucaryotes photosynthétiques, de nombreux procaryotes se sont également fiés au cycle de Calvin pour la fixation du CO2, et de nombreux autres ont au moins hébergé Rubisco. Une riche diversité fonctionnelle de gènes Rubisco a été trouvée dans le sol, ce qui indique qu'un large éventail de bactéries du sol capable de fixation autotrophe du CO2.
Dans une de leur expérience, ils montrent que la faune du sol a dégradé de façon préférentielle les bassins de carbone chimiquement et physiquement les plus stables dans une expérience en microcosme où le sol a été inoculé avec des vers de terre, des enchytraeids, des collemboles et des nématodes.
Ce que cette review apporte au débat :
La dégradation de la matière organique se fait de façon préférentielle par les micro organismes (bactérie et champignons) selon le substrats : composition des sols. Donc la composition des sols (biotique et abiotique) joue un rôle sur les mécanismes de dégradation de la matière organique.
Publiée il y a plus de 6 ans
par
G. Lextrait et A. Duhamet.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.
Préservation des sols et du carbone du sol par le biais de contraintes d'habitat et de limitations biologiques de l'activité des décomposeurs
Résumé de la review :
L'apport en carbone provient principalement de la litière de feuilles, de la litière de racines et des exsudats de racines. Environ 85 à 90 % de la décomposition des matières organiques (MO) dans le sol se fait par voie microbienne et environ 10 à 15 % de l'énergie produite est utilisée par la faune du sol.
La revu montre que les organismes du sol ont des préférences pour différents substrats et se localisent dans différents espaces pédologiques.
La localisation des microorganismes a montré qu'elle n'était pas en adéquation avec la disponibilité en substrat C.
Les champignons assimilent le C directement de la couche de litière, tandis que les bactéries absorbent les substrats du sol sous la litière. L'étendue et l'intensité de la zone active de décomposition bactérienne sont directement liées au transport du soluté par diffusion et convection. L'augmentation de la teneur en eau accélère le transport des substrats solubles, ce qui entraîne une augmentation de la biomasse et de l'activité microbienne, tout en entraînant un épuisement plus rapide des substrats pour la croissance et l'activité microbiennes après la phase initiale. Il semble donc que la décomposition bactérienne des substrats à faible poids moléculaire dépendent de l'efficacité de l'échelle microscopique transport à proximité des populations bactériennes.
Les organismes autotrophes utilisent l'énergie obtenue de la lumière ou de composés inorganiques pour réduire le CO2 et synthétiser la MO. Bien que d'autres voies métaboliques existent, le cycle de Calvin est de loin la voie de fixation du CO2 la plus abondante avec la ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygénase (Rubisco) comme enzyme fixant le CO2. Outre les organismes eucaryotes photosynthétiques, de nombreux procaryotes se sont également fiés au cycle de Calvin pour la fixation du CO2, et de nombreux autres ont au moins hébergé Rubisco. Une riche diversité fonctionnelle de gènes Rubisco a été trouvée dans le sol, ce qui indique qu'un large éventail de bactéries du sol capable de fixation autotrophe du CO2.
Dans une de leur expérience, ils montrent que la faune du sol a dégradé de façon préférentielle les bassins de carbone chimiquement et physiquement les plus stables dans une expérience en microcosme où le sol a été inoculé avec des vers de terre, des enchytraeids, des collemboles et des nématodes.
La dégradation de la matière organique se fait de façon préférentielle par les micro organismes (bactérie et champignons) selon le substrats : composition des sols. Donc la composition des sols (biotique et abiotique) joue un rôle sur les mécanismes de dégradation de la matière organique.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.