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Estimer l'effet d'un caractère binaire sur la spéciation et l'extinction
Introduction à l'article :
L'article essaye de déterminer si le taux de spéciation et d’extinction sont reliés à un seul caractère. Ce caractère serait donc le fondement même de l'évolution d'une espèce.
Dans la controverse ci dessous, cet article pourrait montrer que la stabilité de l'évolution d'une espèce n'est pas liée au mode de reproduction. Cela serait juste un moyen de transmettre les gènes d'un individu à un autre sur plusieurs générations.
Mais dans le cas où un caractère serait déterministe pour l'évolution d'une espèce, cela pourrait être un grand pas pour donner une fermeture au débat sur le mode de reproduction et l'évolution.
Expériences de l'article :
Dans cet étude, ils font des calculs de taux de spéciation et d'extinction grâce ç un arbre phylogénétique. Ils utilisent un modèle avec comme paramètres :
Alors qu'une lignée a un état de caractère 0, le taux de spéciation instantané est λ0, le taux d'extinction est μ0 et le taux de transition vers l'état 1 est q01. De même, alors qu'une lignée a l'état de caractère 1, les taux de spéciation, d'extinction et de transition sont λ1, μ 1 et q10.
Ces paramètres sont supposés constants tout au long de l'arbre. Ils supposent que les transitions se produisent instantanément sur les échelles de temps considérées. Ils supposent également que ces événements sont indépendants les uns des autres; en particulier, et que le changement d'état de caractère ne provoque pas, en soi, de spéciation et vice versa.
Résultats de l'article :
Les estimations des taux de spéciation λ0 et λ1 sont assez bonnes, se rapprochant des valeurs correctes des paramètres. De même, les estimations du cas symétrique (λ0 = λ1 = 0,1) se distinguent facilement des estimations du cas asymétrique (λ0 = 0,1, λ1 = 0,2). Pour les taux d'extinction et les taux de changement d'état des caractères, les estimations ne correspondent pas aussi étroitement aux taux simulés.
Publiée il y a plus de 6 ans
par
D. Saindou.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.
Estimer l'effet d'un caractère binaire sur la spéciation et l'extinction
Introduction à l'article :
L'article essaye de déterminer si le taux de spéciation et d’extinction sont reliés à un seul caractère. Ce caractère serait donc le fondement même de l'évolution d'une espèce.
Dans la controverse ci dessous, cet article pourrait montrer que la stabilité de l'évolution d'une espèce n'est pas liée au mode de reproduction. Cela serait juste un moyen de transmettre les gènes d'un individu à un autre sur plusieurs générations.
Mais dans le cas où un caractère serait déterministe pour l'évolution d'une espèce, cela pourrait être un grand pas pour donner une fermeture au débat sur le mode de reproduction et l'évolution.
Dans cet étude, ils font des calculs de taux de spéciation et d'extinction grâce ç un arbre phylogénétique. Ils utilisent un modèle avec comme paramètres :
Les estimations des taux de spéciation λ0 et λ1 sont assez bonnes, se rapprochant des valeurs correctes des paramètres. De même, les estimations du cas symétrique (λ0 = λ1 = 0,1) se distinguent facilement des estimations du cas asymétrique (λ0 = 0,1, λ1 = 0,2). Pour les taux d'extinction et les taux de changement d'état des caractères, les estimations ne correspondent pas aussi étroitement aux taux simulés.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.