Cette étude revient sur les trois principaux risques environnementaux des cultures transgéniques. Ces derniers sont les risques associés avec la biodiversité (incluant les effets sur les organismes non-ciblés et le fonctionnement des écosystèmes du sol), les risques associés avec les flux de gènes et la recombinaison génétique et enfin les risques en lien avec l'évolution comme le développement de résistances chez les insectes ou "mauvaises herbes" ciblées.
Ces différentes risques sont envisagés à partir de divers impacts directs et indirects étant eux mêmes parfois débattus, et pouvant se résumer en deux grands groupes.

Flux de gènes : Considéré comme une force évolutive majeure, ce phénomène peut avoir des conséquences imprévisibles surtout dans le cas de gènes "artificiels". Cependant, certains évènements sont plausibles car ils ont déjà été observés, comme la modification structurelle de la diversité génétique, l'émergence de nouveaux pathogènes viraux, l'apparition de "superplantes", l'instabilité du transgène dans l'environnement ou encore le développement de résistances chez des organismes ravageurs et pathogènes. Les mécanismes les plus susceptibles d'engendrer des flux de gènes sont la dispersion du pollen, des graines et des propagules végétatives.
Les flux de gènes les plus probables pourraient avoir lieu via des hybridations entre plantes transgéniques et sauvages, via l'utilisation de cultures génétiquement modifiées pour plusieurs traits (transgène stacking), via le transfert horizontal de gènes et via la rémanence du matériel génétique dans l'environnement.

Toxicité : Les plantes ont naturellement des mécanismes de défenses chimiques contre les agresseurs. Une des problématiques majeures des cultures génétiquement modifiées est l'effet de pléiotropie. La transgénèse peut avoir des conséquences non-contrôlés sur d'autres gènes. En imaginant qu'un gène exprimant des toxines soit sous influence de la modification génétique, la production de ces toxines pourrait être perturbée (en augmentant ou en diminuant), entrainant par effet cascade des impacts sur l'environnement. De plus, l'expression de ces toxines est différentielle en fonction des organes. Des modifications spatiales de l'expression de ces toxines pourraient aussi avoir des conséquences. Il a aussi été observé suite à des transgénèses des modifications pléiotropiques structurelles de toxines, engendrant des nouvelles molécules dont les interactions biotiques et abiotiques sont imprévisibles. Au delà de ces influences sur la toxicité naturelle, il va de soi que la problématique qui attire le plus l'attention est la toxicité des protéines Cry qui sont exprimés par les transgènes Bt. Ces protéines sembleraient avoir un impact limité une fois dans l'environnement, dû à leur faible persistance. Or certaines études alertent sur la variabilité de cette rémanence, principalement influencée par des variables environnementales comme la composition du sol. Il est aussi important de se rappeler que les cultures transgéniques herbicides-tolérants n'ont de sens que si des herbicides sont utilisés. La toxicité de l'utilisation de telles cultures est donc aussi indirecte via l'emploi de pesticides, comme le glyphosate dont de plus en plus d'études démontrent ses effets délétères multiples sur les organismes et l'environnement.

La revue est particulièrement rigoureuse puisqu'à elle seule elle permet d'avoir une vue d'ensemble sur la controverse, et ce avec un regard actuel. Tous les effets possibles sont décryptés et plus ou moins soutenus par la littérature. Les enjeux sont exposés et une longue liste de mesures sont proposés en fin de document pour améliorer les études sur cette controverse. Bien qu'aucune déclaration ne soit faite sur les conflits d'intérêt, la parcimonie des auteurs couplée aux avertissements sur les risques potentiellement catastrophiques font de cette revue un document qui je pense est de confiance, de pertinence et d'importance.

Cette revue permet de constater que la controverse est toujours d'actualité, et que de nombreuses problématiques ont alimenté le débat avec la progression des connaissances et des outils technologiques. Il est étonnant de constater que même une trentaine d'années après l'adoption des cultures génétiquement modifiées, un tel manque d'homogénéisation des protocoles dévaluation des risques existe encore. Malgré tout, il est aujourd'hui indéniable que les cultures transgéniques ont des effets sur l'environnement. Les questions qu'il reste à résoudre sont multiples, mais il est désormais impératif d'affiner les études au cas par cas et d'obtenir plus de données sur le long-terme afin d'évaluer le vrai impact des OGM sur la dynamique des écosystèmes.