La canne à sucre (hybrides de Saccharum spp.) est la principale culture de sucre et une matière première industrielle prometteuse pour les biocarburants. Cependant, l'un des problèmes majeurs de cette culture est la sensibilité aux attaques d'insectes (Diatraea saccharalis, Lepidoptera, Cambridae). Pour lutter contre ces derniers, le gène Cry1Ac de la canne à sucre Bt s'est avéré être une stratégie efficace et économique pour améliorer sa résistance aux ravageurs. Mais ce gène pourrait être négatif sur le sol qui est un élément essentiel pour la croissance des plantes, et les micro-organismes de la rhizosphère jouent un rôle majeur dans les transformations des nutriments et le cycle des éléments. cet article évalue le flux génétique par transfert horizontal de gènes, les effets sur la diversité structurelle et fonctionnelle des micro-organismes et les activités enzymatiques dans des échantillons de sol sous des lignées de canne à sucre cry1Ac et non génétiquement modifiée.

Des expériences sur le terrain sur de petites parcelles dans des conditions naturelles ont été menées dans un champ d'essai pilote. Après avoir cultivé de jeunes plants des lignées de canne à sucre transgénique FN95-1702 et cry1Ac en serre, des parcelles de terrain de 5,2 × 1,1 m a été plantée avec 35 jeunes plants. Le sol de la rhizosphère (3 répliques par échantillon) à trois étapes principales de la période de croissance de la canne à sucre: le sol de la rhizosphère provenant des 5 sites d'échantillonnage par bloc a été mélangé. Les échantillons de sol ont ensuite été tamisés à l'aide d'un tamis de 2 mm, homogénéisés et conservés à 4 ° C jusqu'à un autre dosage. Le flux de gènes a été détecté par PCR. La diversité de la communauté microbienne a été mesurée par la méthode classique de comptage sur paque. La diversité fonctionnelle de la communauté microbienne a été déterminée par biolog ecoplate. Le dosage enzymatique et l’analyse DGGE ont été réalisés.

La détection de flux génique de la canne à sucre cry1Ac par PCR dans le sol de la rhizosphère a montré qu'il n'y a pas de transfert de gènes exogènes des lignées transgéniques de canne à sucre vers les microorganismes du sol de la rhizosphère.
Les effectifs de la population de bactéries cultivables ou d'actinomycètes et de champignons dans le sol de la rhizosphère GM n'ont montré aucune différence significative par rapport à ceux de la lignée témoin FN95-1702.
Le modèle de variation des activités enzymatiques du sol de la rhizosphère entre les lignées de canne à sucre GM et la canne à sucre non GM tout au long de leur développement n'a montré aucune tendance cohérente. Les auteurs ont pensé que le changement des activités enzymatiques du sol peut résulter des différences dans les propriétés chimiques du sol telles que le pH, l'addition d'engrais ou / et certains autres facteurs naturels.

Les auteurs de cet article ont réalisé les expériences à 3 reprises. Ce qui permet de bien apprécier les résultats. Toutefois, ce travail a été réalisé pour une saison de culture. Il serait intéressant de le faire sur plusieurs saisons pour mieux mesurer l’impact de la canne à sucre génétiquement modifiée sur la communauté microbienne cultivable dans le sol de la rhizosphère.

Cet article montre que, sur la base d'une saison de culture, que les lignées de canne à sucre cry1Ac peuvent ne pas affecter la structure de la communauté microbienne et la diversité fonctionnelle du sol de la rhizosphère, mais peuvent avoir peu d'effets négatifs sur les enzymes du sol.