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Les groupes M et N de HIV-1 sont issus du SIVcpz_Ptt_ présent chez le chimpanzé Pan troglodytes troglodytes. L'origine du SIVcpz est elle-même inconnue et pourrait permettre à la fois de localiser les premiers foyers de SIVcpz et de mieux comprendre la transmission inter-espèces. Dans ce court article, les autres recherchent les origines de SIVcpz.
Expériences de l'article :
L'expérience de cet article consiste en une comparaison de 8 espèces de SIV différentes (gsn, syk, sm, rcl, agm, mnd, lhoest et col). Des séquences de gag, pol et env, jugées comme non recombinantes sont comparées avec celles de SIVcpz.
Résultats de l'article :
SIVcpz semble être notamment issu d'une recombinaison de SIVrcm (pour le gène pol) présent chez Cercocebus torquatus et SIVgsn (env) présent chez Cercopithecus nictitans deux singes présents au Cameroun et chassés par le chimpanzé.
Rigueur de l'article :
Dans cet article, seules les protéines de structures virales sont analysées. Il aurait été très intéressant d'analyser les protéines accessoires notamment responsables de la lutte contre les facteurs de restriction.
De plus, tout cet article repose uniquement sur des données phylogénétiques de comparaisons statistiques de séquences génétiques. Les analyses ont été découpées en comparaisons de groupe de quatre espèces de SIV et l'absence d'informations sur les tests statistiques réalisés ne permet pas de savoir si cet enchaînement de comparaisons ne multiplie pas le risque statistique à chaque fois.
Ce que cet article apporte au débat :
Cet article montre qu'un lentivirus peut passer la barrière inter-espèces de façon naturelle par le biais de recombinaisons et que celui-ci peut se répandre dans la nouvelle population cible. De plus, cette transmission semble être le résultat de la chasse de singes par les chimpanzés ce qui met en avant l'hypothèse que la chasse du chimpanzé a pu permettre la transmission du SIVcpz à l'homme en HIV-1.
Enfin, ces informations permettent de faire l'hypothèse que le Cameroun est le lieu de départ de l'épidémie de SIVcpz ce qui concorde avec les hypothèses de transmissions singe-homme.
Remarques sur l'article :
C'est un article relativement vieux (2003) aujourd'hui et le sujet n'a plus vraiment été abordé depuis.
Publiée il y a plus de 10 ans
par
A. Rey.
Dernière modification il y a plus de 10 ans.
Origine hybride du SIV chez les chimpanzés
Introduction à l'article :
Les groupes M et N de HIV-1 sont issus du SIVcpz_Ptt_ présent chez le chimpanzé Pan troglodytes troglodytes. L'origine du SIVcpz est elle-même inconnue et pourrait permettre à la fois de localiser les premiers foyers de SIVcpz et de mieux comprendre la transmission inter-espèces. Dans ce court article, les autres recherchent les origines de SIVcpz.
L'expérience de cet article consiste en une comparaison de 8 espèces de SIV différentes (gsn, syk, sm, rcl, agm, mnd, lhoest et col). Des séquences de gag, pol et env, jugées comme non recombinantes sont comparées avec celles de SIVcpz.
SIVcpz semble être notamment issu d'une recombinaison de SIVrcm (pour le gène pol) présent chez Cercocebus torquatus et SIVgsn (env) présent chez Cercopithecus nictitans deux singes présents au Cameroun et chassés par le chimpanzé.
Dans cet article, seules les protéines de structures virales sont analysées. Il aurait été très intéressant d'analyser les protéines accessoires notamment responsables de la lutte contre les facteurs de restriction.
De plus, tout cet article repose uniquement sur des données phylogénétiques de comparaisons statistiques de séquences génétiques. Les analyses ont été découpées en comparaisons de groupe de quatre espèces de SIV et l'absence d'informations sur les tests statistiques réalisés ne permet pas de savoir si cet enchaînement de comparaisons ne multiplie pas le risque statistique à chaque fois.
Cet article montre qu'un lentivirus peut passer la barrière inter-espèces de façon naturelle par le biais de recombinaisons et que celui-ci peut se répandre dans la nouvelle population cible. De plus, cette transmission semble être le résultat de la chasse de singes par les chimpanzés ce qui met en avant l'hypothèse que la chasse du chimpanzé a pu permettre la transmission du SIVcpz à l'homme en HIV-1.
Enfin, ces informations permettent de faire l'hypothèse que le Cameroun est le lieu de départ de l'épidémie de SIVcpz ce qui concorde avec les hypothèses de transmissions singe-homme.
C'est un article relativement vieux (2003) aujourd'hui et le sujet n'a plus vraiment été abordé depuis.
Dernière modification il y a plus de 10 ans.