Au cours de son évolution, l'homme a adopté un régime omnivore. Ce dernier a été toujours considéré comme le meilleur pour l'organisme humain contrairement aux autres régimes : végétarien et végétalien. Souvent, le choix de l'adoption d'un régime alimentaire par rapport à un autre est influencé par les avantages qu'ils peuvent en procurer à l'homme. Actuellement, la relation entre microbiote intestinal et les avantages sanitaires apportés sont largement étudiés par la communauté scientifique. Ainsi, un microbiote intestinal non perturbé est souvent associé à une meilleure protection contre de nombreuses pathologies. Cette diversité bactérienne est influencée par l'alimentation. Donc le changement d'un régime alimentaire peut augmenter ou diminuer l'abondance d'un groupe d'espèces (et ou ces entérotypes) dans la flore. Cette revue montre qu'effectivement en fonction du régime adopté, le microbiote intestinal est différent et qu'il est capable de s'adapter au nouveau régime alimentaire.
Cette revue montre également que l'adoption du régime alimentaire végétalien modifie le microbiote intestinal. Ce dernier se différencie des autres régimes par l'abondance des bactéries capable de dégrader puis fermenter les fibres alimentaires. Egalement les études ont prouvé que les fibres alimentaires apportées par les plantes diminuent le niveau d'inflammations, ce qui prouve une fois de plus que ce régime végétalien est particulier et confère de nombreux avantages sur la santé humaine. Ce changement a permis la réduction des pathobiontes comme les espèces appartenant à la famille des Enterobacteriaceae souvent responsables des diarrhées et favorise également l'implantation des espèces protectrices comme faecalibacterium prausnitzii (Bactérie anti-inflammatoire).

En effet, en réponse à un changement du régime alimentaire, le microbiote intestinal est capable de s'adapter rapidement au nouveau régime que ce soit omnivore, végétarien ou végétalien. Cette adaptation du microbiote intestinal montre qu'effectivement l'homme peut adopter un régime strictement végétalien et se passer donc de la viande sans pour autant porter préjudice à sa santé, car ce régime végétalien semble être particulier et confère de nombreux avantages sanitaires. Cependant, il est clair qu’après avoir arrêté ce régime végétalien, très vite le microbiote intestinal est restauré par rapport à son ancien régime habituel omnivore. Malgré les effets bénéfiques sur la santé humaine annoncés dans cette revue, l'utilisation de ce régime végétalien comme thérapie nécessite des études beaucoup plus approfondies et qu'il est également important de faire la différence entre la diversité microbienne de l'intestin pour un régime végétalien à court et à long terme.