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Titre de l'article :

Est-ce que l'urbanisation façonne la composition des communautés bactériennes dans les parcs urbains ? Etude de cas sur 16 villes chinoises basée sur une méthode de pyroséquençage.


Introduction à l'article :

Les bactéries sont impliqués dans de nombreux cycles biogéochimique terrestres ou aquatiques et de plus en plus d'études se focalisent sur la biogéographie et la diversité des communautés microbiennes du sol. Beaucoup d'études ont tentés de comprendre comment les communautés microbiennes pouvaient-être influencées par les caractéristiques physiques, chimiques et biologique des écosystèmes. Le pH est un facteur environemental important mais les formes de carbone organiques et d'autres facteurs peuvent contribuer au changement des communautés microbiennes du sol. Parmis les activités humaines, l'effet de l'urbanisation sur les animaux,les plantes et les micro-organismes a été peu étudié. Les objectifs de cette étude sont déterminer les taxons dominants en ville, d'observer les différences d'abondance de ces taxons au travers de toute la Chine et de déterminer les facteurs environnementaux déterminants la structure des communautés microbiennes dans les parcs urbains.

Expériences de l'article :

Echantillons provenant de 16 villes Chinoises.
Séquençage par 454-pyroséquençage ARN16S
Analyse CCA (canonical correspondence analysis) et VPA (variance partition analyses)

Résultats de l'article :

Charactéristiques géochimiques
Commposition des taxons dominants de bactéries dans les sols des parcs urbains
Corrélation entre les facteurs environnementaux et la composition des communautés bactériennes : facteurs dirigeant la variation

Rigueur de l'article :

Pas de problèmes a part que la 454 n'est pas la technologie la plus adapatée.

Ce que cet article apporte au débat :

La preuve que l'urbanisation a une influence sur la composition des communautés bactériennes ( et plus généralement microbienne ?) et influence du pH (façonne les communautés)

Publiée il y a plus de 9 ans par J. Quilbe.
Dernière modification il y a plus de 9 ans.