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Réveiller les morts-vivants : implications d'un modèle explosif pour le temps de diversification des mammifères placentaires
Figure :
Dans cet article :
Figure 3 (gauche) : Arbre comprenant les 117 taxons mammifères de Meredith et al. (2011) , moins les 47 >10 kg et/ou avec une durée de vie > 40ans.
Les cercles noirs pleins sont les nœuds calibrés et les rouges ouverts indiquent les divergences interordinales, toutes datent du Crétacé. La** ligne bleue en pointillée** correspond à la limite K/Pg .
Figure 5 (droite) : Graphiques représentant, au cours du temps géologique, (A) le nombre de nouveaux taxons Euthériens fossiles ; (B) le nombre de nouvelles lignées. La taille des flèches indique les changements de taux par rapport au stade géologique précédent : petite (50-99,9%), moyenne (100-999,9%) et grosse (> 1000%) . Le signe infini ∞ montre que l'étape précédente n'a pas de nouvelle lignée. Le - 100% indique l'absence de nouvelle lignée dans l'étape actuelle. Les courbes dR27b, Emer15 et Mer82c correspondent à différentes horloges moléculaires identifiées dans d'autres études.
Introduction à l'article :
Evolution des placentaires :
Modèle explosif (O'Leary et al., 2013), radiation inter et intra-ordinale après la crise Crétacé/Tertiaire : Euthériens non considérés de placentaires (pléontologues, études cladistiques écomorphologiques). Qualifié de "doux" avec apparition des principaux clades au Crétacé, mais principale diversification après.
Modèle long fusible, radiation par cladogenèse inter-ordinale au Crétacé et intra-ordinale après la crise (études moléculaires);
Modèle court fusible (Bininda-Emonds et al., 2007), radiations inter et intra-ordinales avant la crise (études de super arbres et horloges moléculaires).
Le registre fossile est placé indépendamment des consensus phylogénétiques (arbre). Une lignée fantôme est un segment de l'arbre entre un nœud (plus ancien) et le premier fossile (plus récent) de cette lignée : l'enregistrement fossile est donc incomplet. Inversement, une lignée zombie apparaît lorsque le nœud est plus récent que le fossile, ce sont des morts vivants !
Expériences de l'article :
Analyses de données moléculaires provenant de 122 taxons, comprenant au moins un représentant de tous les ordres placentaires (excepté 4). Les gros organismes (>10kg) et à durée de vie longue (40ans) ont été retirés de l'analyse car ils sous-estiment les temps de divergence.
Résultats de l'article :
Au moins 61 des 136 nœuds internes de Placentalia ont des âges estimés plus jeunes que les âges minimums impliqués dans les enregistrements fossiles. Il s'agit de taxons de petites tailles et courtes durées de vie. 5 lignées zombies dépassent 20 millions d'années. Logiquement, ces lignées ne doivent pas exister. Excepter si l'âge minimum des fossiles est inexact ou si les fossiles sont attribués à un groupe taxonomique incorrect, faits avérés. Cette application de lignées zombies permet de corriger les lignées fossiles, avec des écarts inférieurs à la plupart des autres études. La radiation inter-ordinale de Placentalia est estimée à 90,2Ma. La découverte d'une nouvelle espèce de Protungulatum dans les roches du Crétacé supérieur plus anciennes de 300 000ans à la crise témoigne que les divergence interordinales des Laurasiatheria contredisent les modèles explosifs.
Modèle long fusible retenu.
Ce que cet article apporte au débat :
Au Maastrichtien (avant la crise), seulement 2 familles, 13 genres et 20 espèces émergent contre respectivement 29, 128 et 248 au Danien (après la crise). Cela représente des augmentations de 1910% (soit 6,59nouvelles lignées par million d'années), 1265% (soit 29,09 NL/Myr) et 1619% (soit 56,36 NL/Myr). Ce sont les plus importantes pour chacune des catégories de taxons, du Crétacé à l'Eocène.
Les divergences entre les estimations moléculaires et paléontologiques peuvent être expliquées par :
les groupes cladistiques morphologiques
les phylogénies inexactes
le "pull of the recent", c'est-à-dire une plus grande diversité vers l'actuelle comparé au passé compte tenue d'une meilleure connaissance des taxons modernes qui sont moins soumis à la taphonomie et plus facilement analysables.
Remarques sur l'article :
Gros travail de comparaisons de données et d'apparition des ordres entre plusieurs études !
Publiée il y a plus de 8 ans
par
E. Zarzoso et A. Laverré.
Dernière modification il y a plus de 6 ans.
Réveiller les morts-vivants : implications d'un modèle explosif pour le temps de diversification des mammifères placentaires
Dans cet article :
Figure 3 (gauche) : Arbre comprenant les 117 taxons mammifères de Meredith et al. (2011) , moins les 47 >10 kg et/ou avec une durée de vie > 40ans.
Les cercles noirs pleins sont les nœuds calibrés et les rouges ouverts indiquent les divergences interordinales, toutes datent du Crétacé. La** ligne bleue en pointillée** correspond à la limite K/Pg .
Figure 5 (droite) : Graphiques représentant, au cours du temps géologique, (A) le nombre de nouveaux taxons Euthériens fossiles ; (B) le nombre de nouvelles lignées. La taille des flèches indique les changements de taux par rapport au stade géologique précédent : petite (50-99,9%), moyenne (100-999,9%) et grosse (> 1000%) . Le signe infini ∞ montre que l'étape précédente n'a pas de nouvelle lignée. Le - 100% indique l'absence de nouvelle lignée dans l'étape actuelle. Les courbes dR27b, Emer15 et Mer82c correspondent à différentes horloges moléculaires identifiées dans d'autres études.
Evolution des placentaires :
Le registre fossile est placé indépendamment des consensus phylogénétiques (arbre). Une lignée fantôme est un segment de l'arbre entre un nœud (plus ancien) et le premier fossile (plus récent) de cette lignée : l'enregistrement fossile est donc incomplet. Inversement, une lignée zombie apparaît lorsque le nœud est plus récent que le fossile, ce sont des morts vivants !
Analyses de données moléculaires provenant de 122 taxons, comprenant au moins un représentant de tous les ordres placentaires (excepté 4). Les gros organismes (>10kg) et à durée de vie longue (40ans) ont été retirés de l'analyse car ils sous-estiment les temps de divergence.
Au moins 61 des 136 nœuds internes de Placentalia ont des âges estimés plus jeunes que les âges minimums impliqués dans les enregistrements fossiles. Il s'agit de taxons de petites tailles et courtes durées de vie. 5 lignées zombies dépassent 20 millions d'années. Logiquement, ces lignées ne doivent pas exister. Excepter si l'âge minimum des fossiles est inexact ou si les fossiles sont attribués à un groupe taxonomique incorrect, faits avérés. Cette application de lignées zombies permet de corriger les lignées fossiles, avec des écarts inférieurs à la plupart des autres études. La radiation inter-ordinale de Placentalia est estimée à 90,2Ma. La découverte d'une nouvelle espèce de Protungulatum dans les roches du Crétacé supérieur plus anciennes de 300 000ans à la crise témoigne que les divergence interordinales des Laurasiatheria contredisent les modèles explosifs.
Modèle long fusible retenu.
Au Maastrichtien (avant la crise), seulement 2 familles, 13 genres et 20 espèces émergent contre respectivement 29, 128 et 248 au Danien (après la crise). Cela représente des augmentations de 1910% (soit 6,59nouvelles lignées par million d'années), 1265% (soit 29,09 NL/Myr) et 1619% (soit 56,36 NL/Myr). Ce sont les plus importantes pour chacune des catégories de taxons, du Crétacé à l'Eocène.
Les divergences entre les estimations moléculaires et paléontologiques peuvent être expliquées par :
Gros travail de comparaisons de données et d'apparition des ordres entre plusieurs études !
Dernière modification il y a plus de 6 ans.