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Conservation ex situ d'espèces sauvages de plantes : il est temps de ré-évaluer les hypothèses génétiques et l'impact des banques de graines.
Conservation ex situ d'espèces sauvages de plantes : il est temps de ré-évaluer les hypothèses génétiques et l'impact des banques de graines.
Résumé de la review
Les banques de graines permettent de garder des individus dormants jusqu'à ce qu'ils soient nécessaires pour maintenir ou ré-établir une population.
Principes et fonctionnement :
Allèles neutres et échantillonnage aléatoire : pas de sélection sur le phénotype ou la génétique des graines à conserver donc on passe potentiellement à côté de la diversité génétique de la population, notamment pas de récolte des allèles rares. Pour pallier à ça il faut plusieurs échantillonnages ou de grands échantillons. Il y a aussi des pertes de la diversité dans les banques de graines dues à la mort de graines et au manque d'apparition de nouvelles mutation. Elles peuvent être en partie contrecarrées par la germination des graines stockées pour ensuite stocker les graines de ces individus. Cette méthode peut échouer si on ne conserve pas la variation nécessaire à la survie de l'espèce.
La sélection peut s'exercer différemment sur les différentes populations d'une espèce. La ** variation génétique quantitative** est l'héritabilité d'un trait. La sélection neutre ne capturera pas forcément la variation génétique quantitative adéquate.
Les corrélations génétiques représentent le degré avec lequel deux traits sont influencés par les mêmes gènes et exprimés ensembles. Elle peut être différente entre les populations, suivant l'environnement et les pertes ayant lieu en conservation ex situ peuvent avoir des impact sur plusieurs traits phénotypiques importants. Le stockage peut aussi modifier les corrélations entre gènes.
Interactions entre génotype et environnement : c'est le lien entre les génotypes et leurs compétences dans un environnement particulier. Or le stockage est un environnement particulier donc certains génotypes seront meilleurs que d'autres dans cet environnement. C'est aussi important à prendre en compte pour la réintroduction car il faut bien choisir le génotype suivant l'habitat choisi ou avoir suffisamment de diversité génétique pour qu'il y ait une chance de succès. L'introduction d'individus dans une population en déclin peut causer plus de mal que de bien, car cela répandrait des gènes moins bien adaptés à l'environnement que les gènes des individus sauvages.
Une combinaison de différents gènes ou allèles peut mener à la bonne adaptation au milieu. Il faut calculer la taille idéale de l'échantillon à prélever pour avoir une bonne diversité.
Critique des banques de graines :
Il y a plus de données sur des enzymes (lysozymes) que sur l'ADN car c'est plus facile à avoir. Pourtant les protéines ne représentent pas fidèlement les variations génétiques à cause du code génétique dégénéré. Les isozymes permettent seulement d'estimer la variabilité génétique d'un échantillon.
Les allèles rares peuvent être important pour comprendre l'évolution, c'est pourquoi il ne faut pas les négliger, notamment lors de l'échantillonnage.
Les banques de graines ne sont pas une assurance de conserver la biodiversité car sans investissements constants de personnel et de moyens elles ne permettent pas de conserver la diversité génétique, donc au final les graines conservées ne seront peut être plus aptes à survivre dans la nature. Ainsi, on peut finalement préserver une population très différente de celles d'origine.
Ces banques de graines permettent uniquement de préserver les espèces connues et en aucun cas celles encore inconnues. Elles ne préservent pas les liens qui existent entre les différentes espèces, les graines stockées sont des entités isolées. Il est donc préférable de préserver l'écosystème entier.
*Utilité des banques : *
Ce sont des réservoirs d'individus utiles dans le cas d'un événement de perte démographique. Mais il faudra garder en tête que ce mélange de deux populations adaptées à différents environnement peut être négatif.
*Conclusions : *
La conservation ex situ peut devenir obligatoire mais il faudra alors faire un suivi précis des lignées et stocker les graines par lignée et non pas en stockage de masses.
Les banques de graines permettent de garder des individus dormants jusqu'à ce qu'ils soient nécessaires pour maintenir ou ré-établir une population.
Principes et fonctionnement :
Allèles neutres et échantillonnage aléatoire : pas de sélection sur le phénotype ou la génétique des graines à conserver donc on passe potentiellement à côté de la diversité génétique de la population, notamment pas de récolte des allèles rares. Pour pallier à ça il faut plusieurs échantillonnages ou de grands échantillons. Il y a aussi des pertes de la diversité dans les banques de graines dues à la mort de graines et au manque d'apparition de nouvelles mutation. Elles peuvent être en partie contrecarrées par la germination des graines stockées pour ensuite stocker les graines de ces individus. Cette méthode peut échouer si on ne conserve pas la variation nécessaire à la survie de l'espèce.
La sélection peut s'exercer différemment sur les différentes populations d'une espèce. La ** variation génétique quantitative** est l'héritabilité d'un trait. La sélection neutre ne capturera pas forcément la variation génétique quantitative adéquate.
Les corrélations génétiques représentent le degré avec lequel deux traits sont influencés par les mêmes gènes et exprimés ensembles. Elle peut être différente entre les populations, suivant l'environnement et les pertes ayant lieu en conservation ex situ peuvent avoir des impact sur plusieurs traits phénotypiques importants. Le stockage peut aussi modifier les corrélations entre gènes.
Interactions entre génotype et environnement : c'est le lien entre les génotypes et leurs compétences dans un environnement particulier. Or le stockage est un environnement particulier donc certains génotypes seront meilleurs que d'autres dans cet environnement. C'est aussi important à prendre en compte pour la réintroduction car il faut bien choisir le génotype suivant l'habitat choisi ou avoir suffisamment de diversité génétique pour qu'il y ait une chance de succès. L'introduction d'individus dans une population en déclin peut causer plus de mal que de bien, car cela répandrait des gènes moins bien adaptés à l'environnement que les gènes des individus sauvages.
Une combinaison de différents gènes ou allèles peut mener à la bonne adaptation au milieu. Il faut calculer la taille idéale de l'échantillon à prélever pour avoir une bonne diversité.
Critique des banques de graines :
Il y a plus de données sur des enzymes (lysozymes) que sur l'ADN car c'est plus facile à avoir. Pourtant les protéines ne représentent pas fidèlement les variations génétiques à cause du code génétique dégénéré. Les isozymes permettent seulement d'estimer la variabilité génétique d'un échantillon.
Les allèles rares peuvent être important pour comprendre l'évolution, c'est pourquoi il ne faut pas les négliger, notamment lors de l'échantillonnage.
Les banques de graines ne sont pas une assurance de conserver la biodiversité car sans investissements constants de personnel et de moyens elles ne permettent pas de conserver la diversité génétique, donc au final les graines conservées ne seront peut être plus aptes à survivre dans la nature. Ainsi, on peut finalement préserver une population très différente de celles d'origine.
Ces banques de graines permettent uniquement de préserver les espèces connues et en aucun cas celles encore inconnues. Elles ne préservent pas les liens qui existent entre les différentes espèces, les graines stockées sont des entités isolées. Il est donc préférable de préserver l'écosystème entier.
*Utilité des banques : *
Ce sont des réservoirs d'individus utiles dans le cas d'un événement de perte démographique. Mais il faudra garder en tête que ce mélange de deux populations adaptées à différents environnement peut être négatif.
*Conclusions : *
La conservation ex situ peut devenir obligatoire mais il faudra alors faire un suivi précis des lignées et stocker les graines par lignée et non pas en stockage de masses.
Ce que cette review apporte au débat
Cette review apporte au débat un point de vue sur la conservation des plantes. Elle montre aussi plusieurs failles de la conservation ex situ avec un point de vue à long terme (conservation de l'évolution).
Cette review apporte au débat un point de vue sur la conservation des plantes. Elle montre aussi plusieurs failles de la conservation ex situ avec un point de vue à long terme (conservation de l'évolution).
Remarques sur la review
Cette revue commence à être vieille et les méthodes ont pu changer depuis. C'est pourquoi elle apporte un avis plutôt négatif sur la conservation ex situ mais avec l'évolution des techniques de conservation, les arguments peuvent ne plus être valables aujourd'hui.
Cette revue commence à être vieille et les méthodes ont pu changer depuis. C'est pourquoi elle apporte un avis plutôt négatif sur la conservation ex situ mais avec l'évolution des techniques de conservation, les arguments peuvent ne plus être valables aujourd'hui.
Publiée il y a plus de 9 ans
par
Manon V. .
Dernière modification il y a plus de 9 ans.
Review : Ex Situ Conservation of Wild Plant Species: Time to Reassess the Genetic Assumptions and Implications of Seed Banks
Titre de la review
Conservation ex situ d'espèces sauvages de plantes : il est temps de ré-évaluer les hypothèses génétiques et l'impact des banques de graines.
Conservation ex situ d'espèces sauvages de plantes : il est temps de ré-évaluer les hypothèses génétiques et l'impact des banques de graines.
Résumé de la review
Les banques de graines permettent de garder des individus dormants jusqu'à ce qu'ils soient nécessaires pour maintenir ou ré-établir une population.
Principes et fonctionnement :
Critique des banques de graines :
Il y a plus de données sur des enzymes (lysozymes) que sur l'ADN car c'est plus facile à avoir. Pourtant les protéines ne représentent pas fidèlement les variations génétiques à cause du code génétique dégénéré. Les isozymes permettent seulement d'estimer la variabilité génétique d'un échantillon.
Les allèles rares peuvent être important pour comprendre l'évolution, c'est pourquoi il ne faut pas les négliger, notamment lors de l'échantillonnage.
Les banques de graines ne sont pas une assurance de conserver la biodiversité car sans investissements constants de personnel et de moyens elles ne permettent pas de conserver la diversité génétique, donc au final les graines conservées ne seront peut être plus aptes à survivre dans la nature. Ainsi, on peut finalement préserver une population très différente de celles d'origine.
Ces banques de graines permettent uniquement de préserver les espèces connues et en aucun cas celles encore inconnues. Elles ne préservent pas les liens qui existent entre les différentes espèces, les graines stockées sont des entités isolées. Il est donc préférable de préserver l'écosystème entier.
*Utilité des banques : *
Ce sont des réservoirs d'individus utiles dans le cas d'un événement de perte démographique. Mais il faudra garder en tête que ce mélange de deux populations adaptées à différents environnement peut être négatif.
*Conclusions : *
La conservation ex situ peut devenir obligatoire mais il faudra alors faire un suivi précis des lignées et stocker les graines par lignée et non pas en stockage de masses.
Les banques de graines permettent de garder des individus dormants jusqu'à ce qu'ils soient nécessaires pour maintenir ou ré-établir une population.
Principes et fonctionnement :
Critique des banques de graines :
Il y a plus de données sur des enzymes (lysozymes) que sur l'ADN car c'est plus facile à avoir. Pourtant les protéines ne représentent pas fidèlement les variations génétiques à cause du code génétique dégénéré. Les isozymes permettent seulement d'estimer la variabilité génétique d'un échantillon.
Les allèles rares peuvent être important pour comprendre l'évolution, c'est pourquoi il ne faut pas les négliger, notamment lors de l'échantillonnage.
Les banques de graines ne sont pas une assurance de conserver la biodiversité car sans investissements constants de personnel et de moyens elles ne permettent pas de conserver la diversité génétique, donc au final les graines conservées ne seront peut être plus aptes à survivre dans la nature. Ainsi, on peut finalement préserver une population très différente de celles d'origine.
Ces banques de graines permettent uniquement de préserver les espèces connues et en aucun cas celles encore inconnues. Elles ne préservent pas les liens qui existent entre les différentes espèces, les graines stockées sont des entités isolées. Il est donc préférable de préserver l'écosystème entier.
*Utilité des banques : *
Ce sont des réservoirs d'individus utiles dans le cas d'un événement de perte démographique. Mais il faudra garder en tête que ce mélange de deux populations adaptées à différents environnement peut être négatif.
*Conclusions : *
La conservation ex situ peut devenir obligatoire mais il faudra alors faire un suivi précis des lignées et stocker les graines par lignée et non pas en stockage de masses.
Ce que cette review apporte au débat
Cette review apporte au débat un point de vue sur la conservation des plantes. Elle montre aussi plusieurs failles de la conservation ex situ avec un point de vue à long terme (conservation de l'évolution).
Cette review apporte au débat un point de vue sur la conservation des plantes. Elle montre aussi plusieurs failles de la conservation ex situ avec un point de vue à long terme (conservation de l'évolution).
Remarques sur la review
Cette revue commence à être vieille et les méthodes ont pu changer depuis. C'est pourquoi elle apporte un avis plutôt négatif sur la conservation ex situ mais avec l'évolution des techniques de conservation, les arguments peuvent ne plus être valables aujourd'hui.
Cette revue commence à être vieille et les méthodes ont pu changer depuis. C'est pourquoi elle apporte un avis plutôt négatif sur la conservation ex situ mais avec l'évolution des techniques de conservation, les arguments peuvent ne plus être valables aujourd'hui.
Dernière modification il y a plus de 9 ans.