Previous analyses of relations, divergence times, and diversification patterns among extant mammalian families have relied on supertree methods and local molecular clocks. We constructed a molecular supermatrix for mammalian families and analyzed these data with likelihood-based methods and relaxed molecular clocks. Phylogenetic analyses resulted in a robust phylogeny with better resolution than phylogenies from supertree methods. Relaxed clock analyses support the long-fuse model of diversification and highlight the importance of including multiple fossil calibrations that are spread across the tree. Molecular timetrees and diversification analyses suggest important roles for the Cretaceous Terrestrial Revolution and Cretaceous-Paleogene mass extinction in opening up ecospace that promoted interordinal and intraordinal diversification, respectively. By contrast, diversification analyses provide no support for the Eocene delayed rise of present-day mammals hypothesis.
Titre de l'article
Impacts de la révolution terrestre du Crétacé et de l'extinction du Crétacé-Paléogène sur la diversification des mammifères
Impacts de la révolution terrestre du Crétacé et de l'extinction du Crétacé-Paléogène sur la diversification des mammifères
Introduction à l'article
Il existe plus de 5400 espèces des mammifères, présentant une très grande diversité d'écomorphes, ainsi que de nombreux exemples de convergence évolutive. Le registre fossile est relativement complet, avec environ 220 millions d'années d'évolution représentés. Malgré cette richesse, les moments de diversifications inter et intra-ordinale au sein de ce groupe sont encore très controversés. De même, les impacts de la transition terrestre du Crétacé (ou KTR, avec l'augmentation de la diversité des angiospermes) et de la crise du Crétacé-Paléogène sont encore mal connus. C'est ce que cet article tente d'investiguer.
Il existe plus de 5400 espèces des mammifères, présentant une très grande diversité d'écomorphes, ainsi que de nombreux exemples de convergence évolutive. Le registre fossile est relativement complet, avec environ 220 millions d'années d'évolution représentés. Malgré cette richesse, les moments de diversifications inter et intra-ordinale au sein de ce groupe sont encore très controversés. De même, les impacts de la transition terrestre du Crétacé (ou KTR, avec l'augmentation de la diversité des angiospermes) et de la crise du Crétacé-Paléogène sont encore mal connus. C'est ce que cet article tente d'investiguer.
Expériences de l'article
Ils basent leurs analyses sur des supermatrices d'alignements moléculaires, de plus de 31 000 paires de bases, et plus de 11 000 acides aminés. La matrice regroupe 164 mammifères, 5 groupes externes, et 26 fragments de gènes. Des arbres phylogénétiques sont construits par méthode de maximum de vraisemblance, avec une horloge moléculaire relâchée, mais contraints par des calibrations fossiles datées. Ils estiment ainsi les temps de divergence des différentes lignées.
Ils basent leurs analyses sur des supermatrices d'alignements moléculaires, de plus de 31 000 paires de bases, et plus de 11 000 acides aminés. La matrice regroupe 164 mammifères, 5 groupes externes, et 26 fragments de gènes. Des arbres phylogénétiques sont construits par méthode de maximum de vraisemblance, avec une horloge moléculaire relâchée, mais contraints par des calibrations fossiles datées. Ils estiment ainsi les temps de divergence des différentes lignées.
Résultats de l'article
Leurs analyses montrent l'importance des calibrations fossiles. Ils montrent une divergence entre placentaires et marsupiaux aux alentours de 190 Ma. Chez les placentaires, ils mettent en évidence une diversification inter-ordinale qui s'effectue avant la crise du Crétacé-Paléogène, en synchronicité avec l'augmentation de diversité des angiospermes (Crétacé). La diversification intra-ordinale, elle, semble avoir lieu post KPg, ce qui soutient la théorie du "Long fuse model", ainsi que les impacts respectifs de ces deux transitions majeures (KTR et KPg).
Leurs analyses montrent l'importance des calibrations fossiles. Ils montrent une divergence entre placentaires et marsupiaux aux alentours de 190 Ma. Chez les placentaires, ils mettent en évidence une diversification inter-ordinale qui s'effectue avant la crise du Crétacé-Paléogène, en synchronicité avec l'augmentation de diversité des angiospermes (Crétacé). La diversification intra-ordinale, elle, semble avoir lieu post KPg, ce qui soutient la théorie du "Long fuse model", ainsi que les impacts respectifs de ces deux transitions majeures (KTR et KPg).
Ce que cet article apporte au débat
Cet article soutient le "Long fuse model", avec une apparition des différents ordres actuels de mammifères placentaires durant la transition terrestre du Crétacé, en lien sans doute avec la diversification des angiospermes. Ces ordres semblent se diversifier au cours du Paléogène.
Cet article soutient le "Long fuse model", avec une apparition des différents ordres actuels de mammifères placentaires durant la transition terrestre du Crétacé, en lien sans doute avec la diversification des angiospermes. Ces ordres semblent se diversifier au cours du Paléogène.
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