Previous analyses of relations, divergence times, and diversification patterns among extant mammalian families have relied on supertree methods and local molecular clocks. We constructed a molecular supermatrix for mammalian families and analyzed these data with likelihood-based methods and relaxed molecular clocks. Phylogenetic analyses resulted in a robust phylogeny with better resolution than phylogenies from supertree methods. Relaxed clock analyses support the long-fuse model of diversification and highlight the importance of including multiple fossil calibrations that are spread across the tree. Molecular time trees and diversification analyses suggest important roles for the Cretaceous Terrestrial Revolution and Cretaceous-Paleogene (KPg) mass extinction in opening up ecospace that promoted interordinal and intraordinal diversification, respectively. By contrast, diversification analyses provide no support for the hypothesis concerning the delayed rise of present-day mammals during the Eocene Period.
Titre de l'article
Impact de la Révolution Terrestre Crétacé et de l'extinction K-Pg dans la diversification des mammifères
Impact de la Révolution Terrestre Crétacé et de l'extinction K-Pg dans la diversification des mammifères
Introduction à l'article
La diversité des mammifères vivants et éteints est documentée par les fossiles datant de 220 millions d'années et a évoluée au cours de la période KTR (Createous Terrestrial Revolution) et de l'extinction massive K-Pg.
Il s'agit ici d'un rapport d'analyses des relations, de l'origine des divergences et de la diversification de 97 à 99% des mammifères sur la base d'une matrice moléculaire incluant 164 mammifères, 5 groupes extérieurs et 26 fragments de gènes. Les estimations du temps de divergence entre les espèces à partir des données moléculaires sont basées sur un ensemble de mesures d'échantillonnages fossiles.
La diversité des mammifères vivants et éteints est documentée par les fossiles datant de 220 millions d'années et a évoluée au cours de la période KTR (Createous Terrestrial Revolution) et de l'extinction massive K-Pg.
Il s'agit ici d'un rapport d'analyses des relations, de l'origine des divergences et de la diversification de 97 à 99% des mammifères sur la base d'une matrice moléculaire incluant 164 mammifères, 5 groupes extérieurs et 26 fragments de gènes. Les estimations du temps de divergence entre les espèces à partir des données moléculaires sont basées sur un ensemble de mesures d'échantillonnages fossiles.
Expériences de l'article
L'échantillonnage des taxons a été choisi pour indexer les noeuds plus profonds de Mammifères mais aussi de manière à utiliser des lignées avec des descendants existants qui se sont diversifiés dans le Crétacé, le Paléocène et l'Éocène jusqu'à l'Éocène moyen (40,4 Ma).
L'échantillonnage des taxons a été choisi pour indexer les noeuds plus profonds de Mammifères mais aussi de manière à utiliser des lignées avec des descendants existants qui se sont diversifiés dans le Crétacé, le Paléocène et l'Éocène jusqu'à l'Éocène moyen (40,4 Ma).
Résultats de l'article
La date moyenne de séparation entre Placentaires et Marsupiaux est estimée a environ 190 Ma et correspond bien à la découverte d'une branche euthérienne pendant le Jurassique. Les analyses suggèrent que 29 à 32 des lignées de mammifères dont la quasi totalité sont des ordres existants pourraient avoir franchis la crise K-Pg. Plusieurs ordres ont un point de diversification avant la crise K-Pg. Résultat cohérent avec le modèle de diversification des Mammifères en fuseau long, qui postule une diversification inter-ordinale dans le Crétacé, suivie d'une diversification intra-ordinale qui se limite au Cénozoïque bien qu'il y ait des problèmes de concordance des fossiles. Les analyses phylogénétiques basés sur l'ADN et les acides-aminés ont montré une augmentation de la diversification des mammifères dans le Crétacé, soit à ~100 Ma / ~83 Ma, suivies d'une diminution à ~78 Ma. L'augmentation du taux de diversification chez les mammifères correspond à la cladogenèse inter-ordinale.
La date moyenne de séparation entre Placentaires et Marsupiaux est estimée a environ 190 Ma et correspond bien à la découverte d'une branche euthérienne pendant le Jurassique. Les analyses suggèrent que 29 à 32 des lignées de mammifères dont la quasi totalité sont des ordres existants pourraient avoir franchis la crise K-Pg. Plusieurs ordres ont un point de diversification avant la crise K-Pg. Résultat cohérent avec le modèle de diversification des Mammifères en fuseau long, qui postule une diversification inter-ordinale dans le Crétacé, suivie d'une diversification intra-ordinale qui se limite au Cénozoïque bien qu'il y ait des problèmes de concordance des fossiles. Les analyses phylogénétiques basés sur l'ADN et les acides-aminés ont montré une augmentation de la diversification des mammifères dans le Crétacé, soit à ~100 Ma / ~83 Ma, suivies d'une diminution à ~78 Ma. L'augmentation du taux de diversification chez les mammifères correspond à la cladogenèse inter-ordinale.
Ce que cet article apporte au débat
Cette revue appuie l'hypothèse que les mammifères placentaires sont arrivés avant la crise K-Pg mais une grande diversification s'en est suivie par la suite. Elle reprend également le fait qu'il n'y a que très peu de données notamment fossiles le prouvant.
Aucune donnée scientifique n'appuie une augmentation du taux de diversification à la frontière ou au moment de la crise K-Pg.
Les résultats selon lesquels la cladogenèse basale pour la majorité des ordres s'est produite au Cénozoïque, confirment l'hypothèse selon laquelle les ordres modernes de mammifères (actuels) ont pris naissance ou n'ont acquis leurs caractéristiques ordinales définitives qu'après l'extinction de masse du KPg.
L'augmentation du taux de diversification concorde avec l'hypothèse de Benton selon laquelle le KTR (125 à 80 Ma), au cours de laquelle la composante des Angiospermes est passée de 0 à 80 %, a été un événement clé dans la diversification des mammifères et des oiseaux.
Cette revue appuie l'hypothèse que les mammifères placentaires sont arrivés avant la crise K-Pg mais une grande diversification s'en est suivie par la suite. Elle reprend également le fait qu'il n'y a que très peu de données notamment fossiles le prouvant.
Aucune donnée scientifique n'appuie une augmentation du taux de diversification à la frontière ou au moment de la crise K-Pg.
Les résultats selon lesquels la cladogenèse basale pour la majorité des ordres s'est produite au Cénozoïque, confirment l'hypothèse selon laquelle les ordres modernes de mammifères (actuels) ont pris naissance ou n'ont acquis leurs caractéristiques ordinales définitives qu'après l'extinction de masse du KPg.
L'augmentation du taux de diversification concorde avec l'hypothèse de Benton selon laquelle le KTR (125 à 80 Ma), au cours de laquelle la composante des Angiospermes est passée de 0 à 80 %, a été un événement clé dans la diversification des mammifères et des oiseaux.
Figure
Figure 1 : Arbre phylogénétique des mammifères créé sur la base d'une matrice d'acides aminés de 164 mammifères, en comparaison avec 5 sous-groupes de vertébrés (poulet, pintade zébrée, chenille verte, morue et grenouille). Plusieurs nœuds qui demeurent difficiles à résoudre (p. ex., la divergence des placentaires) ont un support variable entre les études sur les changements génomiques, ainsi que les ensembles de données à l'échelle du génome, ce qui suggère que la diversification n'était pas entièrement faite ou s'est produite dans une succession si rapide que le suivi du signal phylogénétique des vraies relations entre espèces pourrait ne pas être recouvrable avec les méthodes actuelles. La limite de KPg est représentée par la transition du fond gris (Mésozoïque) au fond blanc (Cénozoïque). Les branches de Placentalia à code couleur correspondent à Laurasiatheria (vert), Euarchontoglires (bleu), Xenarthra (orange) et Afrotheria (rose).
Source : cet article.
Figure 1 : Arbre phylogénétique des mammifères créé sur la base d'une matrice d'acides aminés de 164 mammifères, en comparaison avec 5 sous-groupes de vertébrés (poulet, pintade zébrée, chenille verte, morue et grenouille). Plusieurs nœuds qui demeurent difficiles à résoudre (p. ex., la divergence des placentaires) ont un support variable entre les études sur les changements génomiques, ainsi que les ensembles de données à l'échelle du génome, ce qui suggère que la diversification n'était pas entièrement faite ou s'est produite dans une succession si rapide que le suivi du signal phylogénétique des vraies relations entre espèces pourrait ne pas être recouvrable avec les méthodes actuelles. La limite de KPg est représentée par la transition du fond gris (Mésozoïque) au fond blanc (Cénozoïque). Les branches de Placentalia à code couleur correspondent à Laurasiatheria (vert), Euarchontoglires (bleu), Xenarthra (orange) et Afrotheria (rose).
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Dernière modification il y a plus de 8 ans.