The fossil record suggests a rapid radiation of placental mammals following the Cretaceous -Paleogene (K-Pg) mass extinction 65 million years ago (Ma); nevertheless, molecular time estimates, while highly variable, are generally much older. Early molecular studies suffer from inadequate dating methods, reliance on the molecular clock, and simplistic and over-confident interpretations of the fossil record. More recent studies have used Bayesian dating methods that circumvent those issues, but the use of limited data has led to large estimation uncertainties, precluding a decisive conclusion on the timing of mammalian diversifications. Here we use a powerful Bayesian method to analyse 36 nuclear genomes and 274 mitochondrial genomes (20.6 million base pairs), combined with robust but flexible fossil calibrations. Our posterior time estimates suggest that marsupials diverged from eutherians 168-178 Ma, and crown Marsupialia diverged 64-84 Ma. Placentalia diverged 88-90 Ma, and present-day placental orders (except Primates and Xenarthra) originated in a ~20 Myr window (45-65 Ma) after the K-Pg extinction. Therefore we reject a pre K-Pg model of placental ordinal diversification. We suggest other infamous instances of mismatch between molecular and palaeontological divergence time estimates will be resolved with this same approach.
Titre de l'article
Des jeux de données phylogénomiques fournissent des précisions sur l'estimation de l'échelle de temps de la phylogénie des mammifères placentaires
Des jeux de données phylogénomiques fournissent des précisions sur l'estimation de l'échelle de temps de la phylogénie des mammifères placentaires
Introduction à l'article
La véracité des estimations du timing de diversification des euthériens obtenues par les approches moléculaires et paléontologiques fait aujourd'hui débat. Les données fossiles indiquent que les groupes-couronnes des euthériens ont commencé à apparaître après la crise Crétacé/Paléogène (K/Pg). Les données moléculaires, elles, indiquent une origine des euthériens précédant cette crise.
Le modèle Short Fuse implique que des groupes couronnes d'euthériens du début du Crétacé ont existé mais dont aucune trace fossile n'a été trouvée. Néanmoins, le registre fossile ne donne qu'une estimation minimum pour certains clades, et le modèle explosif est contredit par l'horloge moléculaire. Les études moléculaires sont d'accord sur une origine crétacéenne des euthériens, mais divergent sur l'ampleur de l'impact de la crise K/Pg sur la diversification.
La véracité des estimations du timing de diversification des euthériens obtenues par les approches moléculaires et paléontologiques fait aujourd'hui débat. Les données fossiles indiquent que les groupes-couronnes des euthériens ont commencé à apparaître après la crise Crétacé/Paléogène (K/Pg). Les données moléculaires, elles, indiquent une origine des euthériens précédant cette crise.
Le modèle Short Fuse implique que des groupes couronnes d'euthériens du début du Crétacé ont existé mais dont aucune trace fossile n'a été trouvée. Néanmoins, le registre fossile ne donne qu'une estimation minimum pour certains clades, et le modèle explosif est contredit par l'horloge moléculaire. Les études moléculaires sont d'accord sur une origine crétacéenne des euthériens, mais divergent sur l'ampleur de l'impact de la crise K/Pg sur la diversification.
Expériences de l'article
L'analyse est faite en deux points :
L'analyse est faite en deux points :
Résultats de l'article
L'origine des euthériens a été estimée à 88-90 Ma. A l'exception des Xénarthres et des primates, les ordres de placentaires se sont diversifiés dans les 20 Millions d'années après la crise K/Pg, par exemple au sein des Laurasiathériens les lignées ancestrales des chats, chiens, ours, chauve-souris, chevaux, rhinocéros, baleines, ruminants, porcs, chameaux, hérissons, taupes et musaraignes ont émergés il y a 45 Ma. De la même manière, la diversification des clades couronnes au sein des Afrothériens, Euarchontoglires (excepté les primates) et même des marsupiaux, sont estimés avoir eu lieu juste après la crise K/Pg.
Les Primates et les Xénarthres se sont diversifiés, d'après les estimations, juste avant la crise K/Pg à 69-67 Ma et 72-67 Ma respectivement.
L'origine des euthériens a été estimée à 88-90 Ma. A l'exception des Xénarthres et des primates, les ordres de placentaires se sont diversifiés dans les 20 Millions d'années après la crise K/Pg, par exemple au sein des Laurasiathériens les lignées ancestrales des chats, chiens, ours, chauve-souris, chevaux, rhinocéros, baleines, ruminants, porcs, chameaux, hérissons, taupes et musaraignes ont émergés il y a 45 Ma. De la même manière, la diversification des clades couronnes au sein des Afrothériens, Euarchontoglires (excepté les primates) et même des marsupiaux, sont estimés avoir eu lieu juste après la crise K/Pg.
Les Primates et les Xénarthres se sont diversifiés, d'après les estimations, juste avant la crise K/Pg à 69-67 Ma et 72-67 Ma respectivement.
Ce que cet article apporte au débat
Cet article apporte des précisions sur l'origine des différents clades d'euthériens. Selon lui, certains groupes auraient commencé à se diversifier avant la crise K/Pg (Xénarthres et Primates) mais pas tous, ce qui contredit le modèle explosif.
Cet article apporte des précisions sur l'origine des différents clades d'euthériens. Selon lui, certains groupes auraient commencé à se diversifier avant la crise K/Pg (Xénarthres et Primates) mais pas tous, ce qui contredit le modèle explosif.
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