Viruses are the most abundant living entities and probably had a major role in the evolution of life, but are still defined using negative criteria. Here, we propose to divide biological entities into two groups of organisms: ribosome-encoding organisms, which include eukaryotic, archaeal and bacterial organisms, and capsidencoding organisms, which include viruses. Other replicons (for example, plasmids and viroids) can be termed ‘orphan replicons’. Based on this suggested classification system, we propose a new definition for a virus — a capsid-encoding organism that is composed of proteins and nucleic acids, self-assembles in a nucleocapsid and uses a ribosome-encoding organism for the completion of its life cycle.
Titre de la review
Redéfinition des virus: leçons de Mimivirus.
Redéfinition des virus: leçons de Mimivirus.
Résumé de la review
Bien que les virus demeurent les unités les plus abondantes et définis souvent comme pouvant être nuisibles, leur statut d'appartenance au vivant reste loin d'être évident pour la communauté scientifique. Dans cette review, Raoult et Forterre proposent de diviser les entités biologiques en deux groupes bien distincts : les organismes codant pour les ribosomes (REO) et les organismes codant pour les capsides (CEO). Sur la base de ce nouveau système de classification, ils suggèrent de redéfinir les virus.
Bien que les virus demeurent les unités les plus abondantes et définis souvent comme pouvant être nuisibles, leur statut d'appartenance au vivant reste loin d'être évident pour la communauté scientifique. Dans cette review, Raoult et Forterre proposent de diviser les entités biologiques en deux groupes bien distincts : les organismes codant pour les ribosomes (REO) et les organismes codant pour les capsides (CEO). Sur la base de ce nouveau système de classification, ils suggèrent de redéfinir les virus.
Rigueur de la review
Dans cette review, les auteurs affirment qu'il n'existe pas de définition claire du virus et que la classification des êtres vivants demeure en perpétuelle évolution. Si actuellement l'arbre de la vie inclut 3 grands règnes que sont les Eucaryotes, les Bactéries et les Archées, la présente review propose une nouvelle dichotomie au sein des entités biologiques : ceux codant pour les capsides et ceux codant pour les ribosomes. Ils reviennent sur la définition d'un organisme et de ce qu'est un être vivant. Les multiples définitions "de la vie" trouvées dans les littérature excluent et incluent à la fois les virus du monde du vivant.
Dans cette review, les auteurs affirment qu'il n'existe pas de définition claire du virus et que la classification des êtres vivants demeure en perpétuelle évolution. Si actuellement l'arbre de la vie inclut 3 grands règnes que sont les Eucaryotes, les Bactéries et les Archées, la présente review propose une nouvelle dichotomie au sein des entités biologiques : ceux codant pour les capsides et ceux codant pour les ribosomes. Ils reviennent sur la définition d'un organisme et de ce qu'est un être vivant. Les multiples définitions "de la vie" trouvées dans les littérature excluent et incluent à la fois les virus du monde du vivant.
Ce que cette review apporte au débat
La review amène une nouvelle définition de ce que sont les virus : organisme codant pour une capside composé de protéines et d’acides nucléiques, s’assemblant dans une nucléocapside et utilisant un organisme codant pour un ribosome, afin de mener à bien son cycle de vie. Avec cette définition, la review explique que nous vivons dans un monde dominé par deux grandes catégories d'êtres vivants : les REO et les CEO laissant à penser que les virus seraient vivants d'après les auteurs.
La review amène une nouvelle définition de ce que sont les virus : organisme codant pour une capside composé de protéines et d’acides nucléiques, s’assemblant dans une nucléocapside et utilisant un organisme codant pour un ribosome, afin de mener à bien son cycle de vie. Avec cette définition, la review explique que nous vivons dans un monde dominé par deux grandes catégories d'êtres vivants : les REO et les CEO laissant à penser que les virus seraient vivants d'après les auteurs.
Remarques sur la review
Raoult et Forterre sont deux auteurs régulièrement cités par leurs pairs autour de ce débat, témoignant de leur implication dans la controverse.
Raoult et Forterre sont deux auteurs régulièrement cités par leurs pairs autour de ce débat, témoignant de leur implication dans la controverse.
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