The red fox ( Vulpes vulpes ) is one of the best-documented examples of a species that has successfully occupied cities and their suburbs during the last century. The city of Zurich (Switzerland) was colonized by red foxes 15 years ago and the number of recorded individuals has increased steadily since then. Here, we assessed the hypothesis that the fox population within the city of Zurich is isolated from adjacent rural fox populations against the alternative hypothesis that urban habitat acts as a constant sink for rural dispersers. We examined 11 microsatellite loci in 128 foxes from two urban areas, separated by the main river crossing the city, and three adjacent rural areas from the region of Zurich. Mean observed heterozygosity across individuals and the number of detected alleles were lower for foxes collected within the city as compared with their rural conspecifics. Genetic differentiation was significantly lower between rural than between rural and urban populations, and highest value of pairwise F ST was recorded between the two urban areas. Our results indicate that the two urban areas were independently founded by a small number of individuals from adjacent rural areas resulting in genetic drift and genetic differentiation between rural and urban fox populations. Population admixture and immigration analysis revealed that urban–rural gene flow was higher than expected from F ST statistics. In the five to seven generations since colonization, fox density has dramatically increased. Currently observed levels of migration between urban and rural populations will probably erode genetic differentiation over time.
Titre de l'article
Le phénomène du renard des villes: conséquences génétiques d'une colonisation récente des milieux urbains.
Le phénomène du renard des villes: conséquences génétiques d'une colonisation récente des milieux urbains.
Introduction à l'article
Depuis une trentaine d'années, les renards roux envahissent les villes d'Europe, d'Amérique du Nord et d'Australie.
Le concept de "puits de dispersion" suggère que les habitats urbains sont des milieux ou les naissances ne compensent pas les morts et seule l'immigration de nouveaux individus empêchent le déclin de la population et son extinction. Au contraire, selon l'hypothèse UIH (Urban Island Hypothesis), les renards roux se sont adaptés aux conditions urbaines, et les conditions propres à chaque habitat (forces de sélections différentes) ont résulté en une isolation reproductive. Donc, une différenciation génétique serait observée entre les habitats urbains et non urbains. Il se peut aussi que la différenciation soit due à un effet fondateur et à la dérive génétique.
Les auteurs utilisent des marqueurs microsatellites pour étudier la population de renards roux de Zurich et de ses alentours. Ils testent l'absence de différenciation sous le concept du "puit de dispersion".
Depuis une trentaine d'années, les renards roux envahissent les villes d'Europe, d'Amérique du Nord et d'Australie.
Le concept de "puits de dispersion" suggère que les habitats urbains sont des milieux ou les naissances ne compensent pas les morts et seule l'immigration de nouveaux individus empêchent le déclin de la population et son extinction. Au contraire, selon l'hypothèse UIH (Urban Island Hypothesis), les renards roux se sont adaptés aux conditions urbaines, et les conditions propres à chaque habitat (forces de sélections différentes) ont résulté en une isolation reproductive. Donc, une différenciation génétique serait observée entre les habitats urbains et non urbains. Il se peut aussi que la différenciation soit due à un effet fondateur et à la dérive génétique.
Les auteurs utilisent des marqueurs microsatellites pour étudier la population de renards roux de Zurich et de ses alentours. Ils testent l'absence de différenciation sous le concept du "puit de dispersion".
Expériences de l'article
Site d'étude et échantillonnage
Laboratoire
Analyses statistiques
Site d'étude et échantillonnage
Laboratoire
Analyses statistiques
Résultats de l'article
Échantillonnage, microsatellites et diversité génétique dans les zones d'échantillonnage
Diversité génétique entre les zones d'échantillonnage
Échantillonnage, microsatellites et diversité génétique dans les zones d'échantillonnage
Diversité génétique entre les zones d'échantillonnage
Rigueur de l'article
Les analyses génomiques et statistiques sont robustes. Les références utilisées sont conséquentes, mais beaucoup sont âgées d'au moins 20 ans. Les techniques utilisées en génomique ont bien progressé depuis, il serait intéressant de s'appuyer sur des études plus modernes. Il ne semble pas y avoir de conflit d'intérêts.
Les analyses génomiques et statistiques sont robustes. Les références utilisées sont conséquentes, mais beaucoup sont âgées d'au moins 20 ans. Les techniques utilisées en génomique ont bien progressé depuis, il serait intéressant de s'appuyer sur des études plus modernes. Il ne semble pas y avoir de conflit d'intérêts.
Ce que cet article apporte au débat
Le rôle de “puits de dispersion” joué par les villes n'est pas soutenu:
Différenciation génétique entre populations rurales et urbaines = faibles échanges.
Différenciation génétique des renards urbains/ruraux:
Colonisation de Zurich:
L'érosion de la différenciation génétique dépend des flux entre populations. Actuellement, les migrations urbaines-rurales sont faibles mais pas rare, on suppose donc une diminution.
Une différenciation génétique suite à une colonisation n'est pas nécessairement le signe d'une diversification spécifique.
Le rôle de “puits de dispersion” joué par les villes n'est pas soutenu:
Différenciation génétique entre populations rurales et urbaines = faibles échanges.
Différenciation génétique des renards urbains/ruraux:
Colonisation de Zurich:
L'érosion de la différenciation génétique dépend des flux entre populations. Actuellement, les migrations urbaines-rurales sont faibles mais pas rare, on suppose donc une diminution.
Une différenciation génétique suite à une colonisation n'est pas nécessairement le signe d'une diversification spécifique.
Remarques sur l'article
Ce travail fait partie de la thèse de Peter Wandeler. Il fait partie d'un projet interdisciplinaire sur l'écologie d'une population croissante de renards roux à Zurich.
Ce travail fait partie de la thèse de Peter Wandeler. Il fait partie d'un projet interdisciplinaire sur l'écologie d'une population croissante de renards roux à Zurich.
Figure
Carte du site d'étude: aires d'échantillonnage de la ville de Zurich (Uwest et Ueast) et des périphéries rurales (Rwest, Rnorth et Reast) et origine des renards analysés (base de donnée géographique: Vector200 © Federal Office of Topography, Suisse)
Carte du site d'étude: aires d'échantillonnage de la ville de Zurich (Uwest et Ueast) et des périphéries rurales (Rwest, Rnorth et Reast) et origine des renards analysés (base de donnée géographique: Vector200 © Federal Office of Topography, Suisse)
Dernière modification il y a plus de 8 ans.