Les organismes du sol contribuent ils aux émissions de gaz à effet de serre ?

La faune du sol a un rôle essentiel dans plusieurs services écosystémiques tel que l'accélération de la décomposition des matières organiques et du cycle des nutriments. Cette décomposition produit des gaz à effet de serre (CO2) mais également en condition aérobie du NH4 +, NO3 -, et SO4 2- qui sont transformés en N2O par les microorganismes, et en anaérobie, des acides organiques pareillement transformés en CO2 et CH4. Le rôle des coléoptères dans la production ou la consommation de certains GES est très controversé.

• Construction sur un terrain (localisation aléatoire) de 24 mésocosmes (3/passerelles) avec comme conditions : fumier libre, fumier couvert (empêche colonisation des dendroctones), sans fumier. Mesure des émissions de GES en début de saison (juin- Aout) et fin de saison (juillet-septembre) : Prélèvement de gaz à 0, 10, 20 et 30 min, et à J0, 1, 2, 3, 7, 10, 14, 14, 21, 28 et 56 jours après le placement de la patte d'excrément. Les concentrations de CO₂, de CH₄ et de N₂O sont déterminées simultanément par chromatographie en phase gazeuse (CG) sur un chromatographe en phase gazeuse automatisé Varian 450 GC.
• Suivi de la dynamique de la colonisation par les dendroctones, du pourcentage d'humidité
• Prélèvement de carottes de sol sous chaque échantillon de fumier : mesure C organique, N (Analyseur de liquide Shimadzu 5200), NO₃⁻ et NH₄⁺ (injection de débit) du sol. Analyse statistique : ANOVA

• Le pourcentage d'humidité du fumier est en corrélation avec la température et les précipitations
• Le pourcentage d'humidité du fumier libre est inférieur au pourcentage d'humidité du fumier couvert
• Le nombre de coléoptères dans le fumier est supérieur dans les premiers jours et diminue au fur et à mesure jusqu'à ce que les coléoptères ne deviennent absents
• Flux de CO₂ plus important (au file du temps) dans le fumier libre que dans le témoin et le fumier couvert (similaires)
• Flux de N₂O est augmenté par les coléoptère dans les jours 3 et 7
• L'activité du dendroctone a augmenté le flux de CH₄ de 0,2 mg C d-1m-2

Points positifs renforçant la rigueur de l'article :

• Emplacement des mésocosmes sur des passerelles aléatoires
• Bouvillons nourris de la même façon entre les 2 réplicats (2014 et 2015)

Cette expérience montre que les dendroctones augmentent le flux de C0₂ de 0,2 g C d−1 m−2 (moins que ce qu'ils avaient déjà montré mais il y avait moins de colonisation qu'avant)
L'augmentation du flux de N₂O coïncide avec l'abondance des dendroctones ainsi que le pourcentage d'humidité.
Augmentation du flux de CH₄ quand les coléoptères arrivent dans le fumier, corrélation avec remonté de CH₄ du sol libéré par les galeries.

Article plutôt complexe pour quelqu'un qui ne s'y connait pas dans ce domaine comme moi

Beaucoup d'incertitudes concernant l'implication de la diversité de la faune du sol sur les émissions de CO₂ et de N₂O existent encore. Les auteurs ont étudiés comment les émissions de CO₂ et de N₂O sont affectées par les espèces et les mélanges d'espèces. Ils se sont intéressés à des combinaisons, allant de 2 à 8 espèces d'organismes du sol, provenant de quatre groupes taxonomiques différents (vers de terre, vers de pot, acariens, collemboles).

La composition des espèces de la faune du sol a été manipulée en microcosmes. Le nombre d'espèces de mésofaune et macrofaune du sol est fixé à 0, une, deux, quatre et huit par microcosme traité. Les huit espèces appartenaient à 4 quatre groupes taxonomiques différents (vers de terre, vers de pot, acariens, collemboles).
Chaque espèce a été assignée au hasard à des traitements pluri-spécifiques avec deux contraintes : (a) chaque espèce doit être représentée par le même nombre d’individus (n=6) et (b) des combinaisons de groupes taxonomiques similaires contiennent une même diversité spécifique.
Les traitements monospécifiques des huit espèces ont été inclus pour quantifier l'effet par individus sur les émissions de N₂O et de CO₂. Ils ont été utilisés pour calculer l'effet net de biodiversité et la dissimilitude fonctionnelle. Deux traitements témoins ont complétés le nombre de traitements à 23.
Les analyses de sol sont faites 3 fois au cours de la durée d'expérimentation : J1(n=4), J47(n=3), J120(n=4).

Il a été constaté qu'une plus grande richesse en espèces et une plus grande dissimilitude fonctionnelle des mélanges d'espèces entraînaient une augmentation des émissions de CO₂ induites par la faune (jusqu'à 10 %), mais une diminution des émissions de N₂O (jusqu'à 62 %).

Les vers de terre, ont été les principaux responsables des émissions de CO₂ et de N₂O. La biodiversité accrue d'autres espèces de la faune du sol en présence de vers de terre a réduit les émissions de N₂O.

Le protocole expérimentale est bien décrit et documenté. D'autres auteurs ont déjà décrit et utilisés cette méthode expérimentale (Heemsbergen et al., 2004). Ceci associé au fait que l’expérience est mené en microcosme, donc en environnement maîtrisé, accentue le potentiel de répétabilité de cette expérience.

Une plus grande diversité fonctionnelle de la faune du sol augmente l'intensité des processus souterrains et entraîne une décomposition plus complète de la litière et une augmentation des émissions de CO₂, mais aussi, une dénitrification plus complète et une diminution des émissions de N₂O. Les résultats suggèrent que l'augmentation de la diversité des espèces de la faune du sol a le potentiel d'atténuer les émissions de N₂O provenant du sol.

• Expériences en microcosmes (contrôle de la diversité ; non représentatif de la dynamique des GES des milieux naturels)
• Le nombre d'individus par microcosme me semble trop faibles que pour pouvoir tirer des interprétations fortes de l'effet de la diversité taxonomique, spécifique et fonctionnelle sur les émission de GES.
• Qu'en est t-il de l'effet de l'abondance taxonomique, spécifique et fonctionnelle sur les émission de GES ?

Introduction
Le sol est une source importante de gaz à effet de serre (GES). Il est en effet estimé que 20% du CO₂, 2/3 du N₂O et 1/3 du CH₄ sont produits par les sols. Ces GES sont en grande partie formés par des processus biotiques microbiens : méthanogenèse, nitrification, dénitrification ou encore la respiration. Les émissions de GES dépendent de nombreux facteurs comme la disponibilité en carbone et en azote, la température et l'humidité du sol par exemple.
Les vers de terre (vdt) sont considérés comme d'importants ingénieurs des écosystèmes. Ils peuvent influencer les émissions de GES :
-Leur tube digestif peut favoriser certains processus microbiens responsables des émissions de GES.
-Ils peuvent modifier certains paramètres physico-chimiques du sol influençant les émissions de GES.
-Ils incorporent des résidus de végétaux dans le sol.
Le nombre de vdt devrait augmenter au cours des prochaines décennies et de nombreuses études ont cherché à comprendre leur effet sur les émissions de GES. Quel est leur effet sur la balance des GES du sol ? L'activité des vdt fait-elle augmenter les émissions de GES par le sol ou au contraire permet-elle une diminution des émissions des GES ?
Les scientifiques ne sont pas tous en accord sur la réponse à cette question et le sujet est encore largement débattu. En effet certaines études soutiennent que les vdt pourraient faire augmenter les émissions de GES du sol tandis que d'autres études soutiennent que l'activité des vdt pourrait au contraire faire diminuer les émissions de ces GES et faire augmenter la séquestration par les sols de composés à l'origine de GES comme le carbone.
Cette review dresse un bilan des études menées sur la question en se focalisant sur les processus influençant la séquestration et les émissions de GES.
Effet des vers de terre sur les émissions de CO₂
Plusieurs expériences à court-terme (environ 30 jours) ont montré que les vers de terre font augmenter les émissions de CO₂. Néanmoins il a été observé que les émissions de CO₂ déclinaient avec une augmentation du temps d'expérimentation, remettant en doute le rôle des vers de terre dans les émissions de CO₂. Certains scientifiques soutiennent que les vers de terre font augmenter les émissions de CO₂ tandis que d'autres appellent à une plus grande prudence vis-à-vis de ces résultats. En effet des études suggèrent que l'activité des vers de terre aurait comme conséquence à plus-long terme une plus importante séquestration de carbone dans les sols, et ainsi une diminution des émissions de CO₂. De plus, les expériences ne prennent pas en compte l'effet combiné des plantes et des vers de terre. En effet les vers, de part leur activité de bioturbation, font augmenter la production primaire. Les émissions de CO₂ stimulées par les vers pourraient ainsi être compensées ou même surcompensées par l'augmentation de l'assimilation de CO₂ par les plantes.
Effet des vers de terre sur les émissions de N₂O
Les études montrent que les vdt font augmenter les émissions de N₂O en favorisant un processus microbien : la dénitrification. Leur tube digestif offre notamment des conditions favorables à la dénitrification. Néanmoins certains auteurs soulignent que l'effet des vdt sur les émissions de N₂O dépend des caractéristiques physico-chimiques du sol.
Effet des vers de terre sur l'émission de méthane CH₄
L'effet des vdt sur les émissions de CH₄ est particulièrement controversé. En effet certaines études montrent une augmentation des émissions de CH₄ en présence de vdt tandis que d'autres études soutiennent au contraire une diminution des émissions de CH₄. Les vdt peuvent affecter de 2 façons contraires les émissions de CH₄ :
-Leur tube digestif offre des conditions favorables pour la formation de CH₄ par le processus de méthanogenèse.
-En augmentant l'aération du sol et la disponibilité en nutriments ils stimulent l'activité des microorganismes méthanotrophes. La méthanotrophie est un processus qui va induire une diminution de la production de méthane par le sol.

Cette review me semble rigoureuse et résume bien les résultats de nombreux travaux de recherche sur le sujet.

Cette review montre, à partir de la littérature disponible (en 2018), que la connaissance sur l'effet global des vers de terre sur les émissions de gaz à effet de serre reste très incomplète.
Cette review insiste sur le fait qu'il faudrait plus d'études de terrain (en conditions naturelles) de long-terme et sur des environnements différents pour réellement pouvoir connaître l'effet global des vers de terre sur les gaz à effet de serre du sol.

La séquestration du carbone dans les sols des agroécosystèmes permettrait à la fois une restauration du stock de carbone et une diminution des émissions de CO₂. Le non-labour est souvent considéré comme une méthode prometteuse pour améliorer le stockage du carbone.
Les systèmes de labour ont une influence sur la diversité et l'abondance des organismes du sol : le non-labour entraine une augmentation de l'abondance et de la diversité des vers de terre par exemple.
Or les organismes du sol tels que les vers de terre peuvent avoir un impact sur la balance des gaz à effet de serre du sol (séquestration de Carbone, émission de CO₂) en modifiant des paramètres physico-chimiques du sol.
Cet article s'intéresse à quantifier à long terme l'effet de la présence des vers de terre sur la balance des gaz à effets de serre dans un système de non-labour (NL) et un système de labour conventionnel (LC).

Dans cette expérience de 750 jours les situations de LC et de NL ont été reproduites artificiellement en mésocosme en enfouissant des résidus de maïs dans le sol et en laissant les résidus à la surface. Les résidus sont ajoutés tous les 190 jours. Les traitements réalisés pour NL et LC étaient :

-Sans vers de terre
-Avec des vers épigés Lumbricus rubellus (125 individus/m²)
-Avec des vers endogés Aporrectodea caliginosa (225 individus/m²)
-Avec L.rubellus + A. caliginosa (respectivement 125 et 225 individus/m²)
Des vers sont rajoutés tous les 190 jours, en fonction de la mortalité afin de maintenir la même densité d'individus (densité moyenne dans les agro-écosystèmes).
Les émissions de CO₂ et N₂O sont mesurées plusieurs fois au cours de l'expérience grâce à un moniteur de gaz photo acoustique INNOVA.
L'évolution du stock de carbone organique dans le sol est calculée à partir des valeurs d'émissions de CO₂ et de l'entrée de C par les résidus.

L'émission des gaz à effets de serre est en moyenne plus importante en non-labour qu'en labour conventionnel. L'effet des vers de terre sur les émissions de gaz à effets de serre est plus importante dans la situation de non-labour qu'en labour conventionnel : les vers de terre font augmenter de 31 à 42% les émissions de gaz à effets de serre dans les situations de non-labour et seulement de 7 à 16% en labour conventionnel.

L. rubellus et A. caliginosa font augmenter les émissions de N₂O et CO₂ dans les deux systèmes de labours.

Aucune augmentation de stockage de carbone dans les sols par l'activité des vers de terre n'a pu être mise en évidence.

Remarque sur les expériences :
Le protocole est bien décrit et rigoureux. Les expériences ont été réalisées en milieu contrôlé et doivent donc être reproductibles. Cependant les expériences ont consisté en des simulations de situation de labour et non-labour et ne représentent pas forcément la réalité sur le terrain.

Remarque sur les auteurs de l'article :
Les auteurs sont reconnus dans ce domaine.

Cet article présente les vers de terre comme des organismes stimulant les émissions de gaz à effets de serre du sol même à une échelle de temps assez importante : 2 ans. Cette expérience va donc dans le sens de la review de lubbers et al., 2013.
Aucune augmentation de stockage de carbone dans les sols par l'activité des vers de terre n'a pu être mise en évidence. Ce résultat est contraire à ce que d'autres études de plus court terme suggéraient. Ces autre études soutenaient une augmentation de la séquestration du carbone dans les sols grâce à l'activité des vers de terre (Bossuyt et al, 2005 ; Zhang et al, 2013).

Les auteurs de cet article sont les même auteurs que ceux de la review controversée "Greenhouse-gas emission from soils increased by earthworms". Cette publication fait suite au débat scientifique déclenché par cette review et les auteurs pourraient éventuellement avoir un intérêt à défendre les résultats de leur précédente review.

Le N₂O, bien que n'ayant beaucoup moins retenu l'attention que le CO₂, est un puissant gaz à effet de serre qui contribue au réchauffement climatique et à la destruction de la couche d'ozone. Le sol est une principale source de N₂O. Le N₂O est essentiellement formé par des processus microbiens : la dénitrification et la nitrification. La capacité des procaryotes à réaliser la dénitrification est répandue (présente chez plus de 60 genres bactériens). Des études ont montré que des champignons (eucaryotes) sont aussi capables de réaliser la dénitrification et qu'ils pourraient être d'importants producteurs de N₂O dans certains écosystèmes. Il a été remarqué que les souches de champignon étudiées ne produisaient pas de protoxyde d'azote réductase et que, par conséquent, le produit final de la dénitrification était le N₂O.
Jusqu'alors, peu d'espèces de champignon avaient été étudiées. Cette étude cherche à déterminer si la production de N₂O est un processus répandu chez les champignons.

Expérience 1
La production de N₂O par une grande variété de champignons a été étudiée (207 souches de champignons appartenant à 23 ordres et 54 genres). Les champignons ont été inoculés dans un liquide de culture dans des conditions favorisant la dénitrification. Une semaine plus tard, la concentration en N₂O est mesuré à l'aide d'une chromatographie en phase gazeuse.
Expérience 2
Pour vérifier que les champignons ne produisent pas du N₂O que dans le liquide de culture, 15 souches produisant du N₂O dans l'expérience1 ont été sélectionnées et inoculées dans 3 types de sol (forestier, de pairie et arable). Cette expérience a été réalisée en microcosme. Un mois plus tard, du nitrite est ajouté pour induire le processus de dénitrification. Des échantillons de gaz ont été récoltés les 2ème, 4ème et 7ème jours après ajout de nitrite et analysés à l'aide d'un chromatographe en phase gazeuse. L'évolution des émissions de N₂O dans la situation contrôle et le traitement inoculé est ensuite comparée.

70 souches parmi les 207 étudiées ont étaient capables de produire du N₂O. La plupart des souches produisant du N₂O font partie des genres Hypocreales, Fusarium et Trichoderma. Les champignons utilisent préférentiellement le nitrite en tant que substrat plutôt que le nitrate. Les champignons ne réduisent pas le N₂O en N2, ainsi le produit final de la dénitrification est toujours le N₂O.
Les résultats de la deuxième expérience montre que les champignons peuvent aussi produire du N₂O en étant inoculés dans le sol. La quantité de N₂O émis dépend de la souche, du type de sol et surtout de l'interaction souche-type de sol. Ainsi Fusarium verticillioides produit plus de N₂O dans le sol forestier, alors que Richoderma harzianum en produit plus en sol de prairie et Metarhizium anisopliaeon en produit plus dans les sols arables. Cet effet interaction souche-type de sol s'explique par le fait que les souches n'ont pas les mêmes besoins en nutriments présents différentiellement selon le sol.

Cet article me semble très rigoureux. Le fait d'avoir tester la contribution des champignons aux émissions de N₂O dans différents types de sol (en plus du liquide de culture) et d'avoir déterminé la capacité de dénitrification d'une grande variété de souches de champignon bien différentes sont des grandes forces de cette étude.
De plus, les auteurs ont fait attention de vérifier dans l'expérience 1 que le N₂O provenait d'une dénitrification biotique (due au champignon) et non pas à une dénitrification abiotique chimique comme cela arrive à faible pH. En effet, après une semaine d'incubation, le pH du liquide de culture était différent en fonction des souches. Afin de différentier la dénitrification biotique et abiotique les auteurs ont déterminé la quantité de N₂O formé dans du liquide de culture non inoculé avec un gradient de pH au bout d'une semaine. Ce test a également été réalisé pour les sol en comparant la quantité de N₂O formé dans les sols inoculés et non inoculés.

Cet article montre que les procaryotes ne sont pas les seuls organismes à produire du N₂O par le processus de dénitrification. Les champignons sont aussi capables de réaliser la dénitrification et la production de N₂O est très répandue chez de nombreuses souches.
Cet article montre clairement que les champignons font ainsi augmenter les émissions de N₂O provenant du sol.

Une humidité élevée des sols favorise les intervalles chauds, c'est à dire de fortes émissions de méthane (CH₄). Par ailleurs certaines communautés tels que les vers de terre peuvent avoir une incidence positive et négative sur ces émissions. Les auteurs ont cherché a tester l'hypothèse selon laquelle ils favoriseraient la production de CH₄ dans les sols riverains, sols inondés, par comparaison avec des sols humides des champs.

• Des échantillons de sol sont prélevés sur les 15 cm supérieurs, soit contenant 31,5% d'humidité soit 100% (même échantillon + 50 ml d'eau distillée), sont incubés en présence (de deux A. turgida) et en l'absence de vers de terre (pots Mason de 1 L auxquels ils ont ajouté 200 g de terre de terrain non mélangée). (n=20)
• Pour chaque condition (n=10), du difluorométhane (DFM) a été ajouté, afin de bloquer l’oxydation du CH₄ et calculer la production brute et la consommation brute du CH₄ (montant brut - le montant net).
• La production de CH₄ est mesurée grâce au prélèvement à différents temps de 2ml de gaz et chromatographe en phase gazeuse du système 450-GC.

Test Shapiro-Wilk et ANOVA bidirectionnelle

• La consommation brute de CH₄ est plus élevée dans les sols saturés.
• Les vers de terre augmentent la production brute de 31 % (p=0,002) et la consommation de 38 % (p=0,004) en 24H
• La production nette de CH₄ était plus faible dans les sols saturés, avec vers de terre

-> Les faibles taux nets de production de CH₄ dans les sols saturés de vers de terre confirment que la méthanotrophie stimulée par l'activité des vers de terre compense le CH₄ produit par les méthanogènes dans les sols saturés. Ce phénomène peut être lié à la disponibilité d'O₂ dans les microsites, dont certains sont anoxiques (pour la production de CH₄) et d'autres toxiques (pour l'oxydation de CH₄).

Contrôle biologie présent : teneur en eau du sol et DFM = pas d'effet important sur la survie des vers de terre.
Contrôle négatif : sans vers de terre

Les vers de terre stimulent la méthanotrophie des sols saturés en eau

Introduction et résultats :
La capacité qu’ont les vers de terre à augmenter la fertilité du sol ainsi que la stabilisation du carbone réside principalement dans le fait qu’ils accélèrent la décomposition et favorise l'agrégation des sols. Ils stimulent la séquestration du carbone dans les agrégats du sol, mais ils augmentent aussi les émissions des principaux gaz à effet de serre (GES) tels que le dioxyde de carbone et le protoxyde d’azote. Par conséquent, la question de savoir si les vers de terre affectent principalement les sols pour agir comme source ou puits net de gaz à effet de serre demeure très controversée. Les auteurs présentent ici un examen quantitatif de l'effet global des vers de terre sur le bilan gaz à effet de serre du sol. Les résultats suggèrent que bien que les vers de terre soient largement bénéfiques pour la fertilité des sols, ils en augmentent les émissions nettes de gaz à effet de serre (+33% pour le CO₂ et +42% pour le N₂O).

Méthode employée :
Les auteurs ont effectué une recherche documentaire dans des publications examinées par des pairs qui faisaient état de l'effet de la présence de vers de terre sur les émissions de GES et/ou la séquestration du carbone dans les sols en utilisant la base de données de recherche ISI-Web of Science. Pour les émissions de N₂O et/ou de CO₂, Les auteurs ont inclus des études comparant les émissions cumulées d'échantillons de sol avec et sans vers de terre après une période expérimentale clairement définie. Pour la séquestration du carbone, les auteurs ont inclus des études qui ont rapporté un COS (carbone organique du sol) après une période expérimentale explicitement indiquée. Au total, 57 études publiées entre 1990 et 2011 ont été trouvées. Les auteurs ont inclus des études qui indiquaient la durée de l'expérience, le groupe fonctionnel des vers de terre et le type d'expérience (c'est-à-dire en laboratoire ou sur le terrain). L'ampleur de l'effet induit par les vers de terre sur les émissions de GES et la séquestration du carbone a été calculée comme le logarithme du rapport de réponse R = ln (E/C) où E et C sont les moyennes des groupes expérimentaux (avec lombrics ajoutés) et témoins (sans vers de terre) respectivement.
Dans toutes les analyses, l'effet moyen sur les vers de terre a été jugé significatif lorsque l'IC à 95 % ne chevauchait pas 0 ; les effets moyens sur les vers de terre pour différents sous-groupes étaient considérés comme étant significativement différents les uns des autres si leurs intervalles de confiance à 95 % ne se chevauchaient pas

• Des facteurs tels que le pH, la texture du sol et la teneur en humidité du sol ont été considérés comme des facteurs déterminants, mais ne sont pas inclus dans cette méta-analyse.
• Concernant le type d'expériences, cette étude compile les résultats de 55 études de terrains et de 180 études en laboratoires. Les études de terrains sont donc sous-représentées. On remarque également que les études sur le terrain ne présentent aucuns résultats témoignant d'une émission de N₂O ou CO₂ par les vers de terre. Ces deux éléments poussent cette méta-analyse à surinterpréter ces résultats, en faisant phi de la réalité du fonctionnement des écosystèmes. Il est d'ailleurs bien connu des biologistes et écologues que les études en laboratoires sont bien moins représentative de la réalité du fonctionnement des écosystèmes que les expérimentations in-situ.

• Les résultats de cette méta-analyse soutiennent que les vers de terre (vdt) augmentent les émissions de GES.
• Les auteurs recommandent que les effets à long terme des vdt sur le bilan des GES soient pris en compte. Au moment de l'écriture de cette review, il n'existait aucune étude de plus de 200 jours sur les effets des vdt sur les émissions de N₂O, que ce soit en laboratoire ou sur le terrain. Les expériences de terrain sur les émissions de N₂O induites par les vdt sont très rares.
• Il n'est toujours pas su dans quelle mesure les effets stimulants des vdt sur la production primaire nette peuvent annuler les augmentations des émissions de GES causées par les vdt.
• Peu de choses sont connues sur les effets de l'interaction entre les vdt et les plantes sur l'équilibre des GES du sol.
  
• Il faurait faire davantage d'études sur des sols intacts sans héritage de l'activité des vdt, des études à long terme, sur le terrain et s'intéresser à des systèmes comportant des plantes en croissance.

Le protoxyde d'azote (N₂O) joue un rôle important dans le débat actuel sur le changement climatique. Les facteurs abiotiques du sol et les analyses microbiennes permettent d'en prédire partiellement les flux. Un rôle possible de la faune du sol a jusqu'à présent été largement négligé.
Différents groupes fonctionnels de la faune du sol contribuent différemment à la minéralisation de l'azote (de Ruiter, 1993). Les facteurs affectant la minéralisation de l'azote peuvent également affecter la dynamique du N₂O. Cette étude vise à quantifier et à comprendre l'effet de la faune du sol sur les émissions de N₂O du sol.
Dans trois expériences, Les auteurs ont testés trois hypothèses : (i) la faune invertébrée du sol autre que les vers de terre augmentent les émissions de N₂O du sol ; (ii) les différentes espèces de faune du sol affectent différemment les émissions de N₂O et (iii) les effets de la faune du sol sur les émissions de N₂O sont plus importants avec une densité de faune supérieure.

Dans trois expériences en microcosme, sur une durée de 62 jours, les auteurs ont mesurés les émissions de N₂O d'espèces d'invertébrés du sol appartenant à différents groupes fonctionnels selon des réseaux trophiques établis (de Ruiter, 1993). Les espèces présentent appartiennent à 5 groupes taxonomiques différents : nématodes, acariens, collemboles, isopodes et annélides. L'humidité est maintenue à 70%.

Expérience 1: Quantifier les émissions de N₂O en présence d'une large gamme d'espèces de faune invertébrée du sol, avec des résidus de foin comme source de C et N.
Expérience 2: Vérifier la cohérence des résultats de l'expérience I dans des conditions physiques du sol légèrement différentes
Expérience 3: Tester l'effet de la densité de la faune sur les émissions de N₂O

Les effets des traitements ont été testées par ANOVA, associé à un post-hoc de comparaisons multiples (Tukey). Le sol avec des résidus de foin, mais sans faune, a servi de traitement témoin dans les trois expériences.

Expérience 1: Les émissions de N₂O ont diminuées avec la présence de vers de terre et de vers de pot, passant de 78,4 (témoins) à 37,0 (vers de terre) ou 53,5 (vers de pot) mg N2O-N m^-2.
Expérience 2: Avec un rapport sol/foin plus élevé, les émissions de N₂O ont augmenté avec les vers à pot de 51,9 (contrôle) à 123,5 mg N₂O-N m^-2.
Expérience 3: Des densités plus élevées de vers de pot accélérent le pic des émissions de N₂O de 5 jours (P < 0,001). Les émissions cumulées de N₂O ne sont pas affectées.

L'augmentation de l'aération du sol par la faune du sol aurait réduit les émissions de N₂O dans l'expérience I. Dans l'expérience II, les émissions de N₂O seraient dues à une disponibilité accrue d'azote et de carbone. Dans l'expérience III, des densités plus élevées de vers de terre ont accéléré la disponibilité de l'azote et du carbone et les émissions de N₂O, mais ne les ont pas accrues.
Les données montrent que la faune du sol peut supprimer, augmenter, retarder ou accélérer les émissions de N₂O du sol.

• Un bel effort de standardisation des traitements et du matériel biologique à été fait.
• Des précautions de vérifications des résultats expérimentaux ont été employées, se qui apporte de la robustesse à cette étude.
  
• Le dispositif expérimental est bien décrit.

La faune invertébré du sol joue un rôle essentiel dans les émissions de N₂O. Elle peut les favoriser ou au contraire les minimiser. Elle influence également la cinétique de ces émissions. Différents groupes fonctionnels et réseaux trophiques peuvent donc être impliqués dans ces variations d'émission de se gaz à effet de serre.

1- L'une des deux espèces de collembole (O. cincta) est indisponible pour l'expérience 2 et la seconde espèce est en effectif réduit (F. candida) pour cause de mortalité.

2- Le fait d'utiliser des microcosmes améliore les chances de répétabilités de cette expérience. Elle est cependant déconnecté de la réalité des milieux naturels, de par un fort contrôle des paramètres biotiques et abiotiques. Ce type d'étude induit également un nombre réduit d’interactions entre organismes, se qui peut poser problème pour une étude qui s'intéresse à l'impact des relations entre groupes fonctionnels et trophiques. De par ces éléments, l'expérimentation en microcosme peut ne pas être représentative de se qui se produit en milieux naturels et anthropisés, notamment dans les sol de parcelles agricoles.

Les vers de terre, en interagissant avec les microorganismes, peuvent affecter la séquestration du carbone dans le sol. Une méta-analyse controversée réalisée par Lubbers et al. en 2013 suggère que les vers de terre font augmenter de 33% les émissions de CO₂ provenant du sol mais n'affectent pas le stock de carbone organique du sol (SCO). Cet article critique et tente de répondre à un nouveau questionnement soulevé par cette méta-analyse : Pourquoi les émissions de CO₂ stimulées par les vers de terre décroissent-elles lorsque le temps de l'expérimentation augmente ?
Les auteurs suggèrent que l'augmentation des émissions de CO₂ par l'activité des vers de terre pourrait être surestimée tandis que son effet sur la stabilisation du carbone pourrait être sous-estimée. Les études prises en compte dans la méta-analyse étaient en effet des études de court-terme et l'effet à long-terme des vers pourrait être différent.

Les expériences ont été réalisées dans des microcosmes expérimentaux en utilisant du sol forestier tamisé et homogénéisé. Trois traitements ont été réalisés. Le SCO du sol a été mesuré avant de démarrer l'expérience.
Traitement 1 : le sol a été incubé pendant 54 jours. Le SCO a été mesuré le 23ème jour et à la fin de l'expérience.
Traitement 2 : le sol a été incubé pendant 23 jours avec des vers de terre Lumbricus rubellus _ (Lu). Au bout des 23 jours le SCO a été mesuré. Les vers ont été retirés et le sol a été incubé pendant 31 jours supplémentaires avant que le SCO ne soit mesuré à nouveau.
Traitement 3 : le sol a été incubé pendant 23 jours avec des vers de terre _Amynthas agrestis (Am). Au bout des 23 jours le SCO a été mesuré. Les vers ont été retirés et le sol a été incubé pendant 31 jours supplémentaires avant que le SCO ne soit mesuré à nouveau.
Au cours de l'expérience, l'humidité a été maintenue constante.

Au bout des 23 jours, la diminution du SCO est plus importante dans les traitements avec les vers de terre que dans les traitements sans vers de terre. Par contre, au cours des 31 jours suivant, la diminution du SCO a continué dans le sol du traitement sans vers de terre alors que le SCO est resté stable dans les sols des traitements avec vers de terre. A la fin de l'expérience, le SCO est similaire dans les trois traitements. Les résultats sont présentés dans la figure.

Les vers de terre accélèrent la minéralisation du carbone (production de CO₂ à partir du carbone organique du sol) mais ne font pas augmenter la quantité totale de carbone minéralisé. Ainsi, à court terme les vers de terre favorisent les émissions de CO₂, mais à long terme ils réduisent les émissions de CO₂ (figure 2). Le sol subi une modification en passant dans le tube digestif des vers de terre et ceci permet une stabilisation du carbone (et une limitation de la formation de CO₂).

Cet article remet en cause les résultats présentés par la méta-analyse de Lubbers et al. 2013.
A court-terme les vers de terre favoriseraient les émissions de CO₂ mais à long-terme ils pourraient réduire les émissions de CO₂ en stabilisant le carbone dans le sol.

Cet article est complexe pour quelqu'un qui ne s'y connait pas dans ce domaine comme moi.
Cet article ne prends pas en compte l'effet combiné des vers de terre et des plantes mais pose une notion très intéressante : la séquestration nette de carbone à l'échelle de l'écosystème est difficile à quantifier dans une simple expérience à court-terme. Les vers de terre interagissent avec les espèces végétales et ont une influence sur la productivité des plantes. L'activité des vers de terre améliore en effet la production primaire et fait donc augmenter la fixation du carbone par les plantes. Ainsi, les émissions de CO₂ stimulées par les vers de terre peuvent être partiellement compensées ou même surcompensées par la séquestration du carbone résultant de l'assimilation de CO₂ par les plantes.

Les principaux gaz à effet de serre (GES) sont le CO₂, le CH₄ et le N₂O. 57% des émissions de N₂O (GES ayant un potentiel de réchauffement climatique 300 fois plus élevé que le CO₂) proviennent du sol. Ce gaz est principalement formé lors du processus de dénitrification, dont les champignons sont capables.
Les champignons mycorhiziens arbusculaires (CMA) sont en interaction symbiotique avec une grande partie des plantes et représentent un groupe répandu de champignons.
Les CMA induisent des modifications de la structure, du pH, et de la disponibilité en eau et carbone du sol. Ces modifications peuvent affecter le processus de dénitrification. De plus, des études ont montré que la présence de ces champignons peut modifier les communautés microbiennes présentes dans la rhizosphère et la mycosphère. Tout cela suggère que les CMA pourraient influencer les émissions de GES du sol.
Cette étude s'intéresse à l'influence des CMA dans les émissions de gaz à effet de serre N₂O provenant du sol.

Expérience 1
Du sol de prairie est récolté et stérilisé afin d'éliminer les CMA indigènes (naturellement présents).
2 traitements sont réalisés : un traitement avec mycorhize (AM) et un traitement sans mycorhize.
Le sol stérilisé est déposé dans chaque microcosme. Pour le traitement AM, un inoculum contenant 3 espèces communes de CMA est ajouté. La stérilisation du sol ayant également éliminé les bactéries, celles-ci sont rajoutées. Des plants de Lolium multiflorum sont ensuite plantés. 28 semaines après des nutriments de l'eau sont ajoutés et les émissions de N₂O et de CO₂ sont mesurées.
Expérience 2
Des microcosmes sont remplis avec du sol contenant un inoculum de CMA.
2 traitements sont réalisés : un traitement avec des plants de tomate W pouvant mycorhizer, et un traitement avec des plants BC1 ne pouvant pas mycorhizer. 10 semaines après leur plantation, de l'eau et des nutriments sont ajoutés et les émissions de GES sont mesurées.

Expérience 1
Les émissions de N₂O sont 42,4% plus importante dans le traitement sans mycorhize que dans le traitement avec mycorhize. La présence de CMA diminue donc les émissions du gaz à effet de serre N₂O.

Expérience 2
Les émissions de N2O sont 33,8% plus importante dans le traitement avec les plants de tomates BC1 ne pouvant pas réaliser de mycorhizes que dans le traitement avec les plants W pouvant réaliser. Les mycorhizes font donc diminuer les émissions de N₂O.

Résultat général : les CMA, en réalisant des mycorhizes avec des plantes, diminuent les émissions de N₂O provenant du sol.

Les expériences menées me semblent rigoureuses. Par exemple, la stérilisation du sol dans l'expérience 1 pour éviter toute contamination par des CMA indigènes et l'ajout des bactéries du milieu d'origine ayant été éliminé au cours de la stérilisation du sol rend ce protocole rigoureux.

Cet article montre que les champignons mycorhiziens arbusculaires font diminuer les émissions du gaz à effet de serre N₂O du sol. Les mycorhizes (interaction entre racines et champignons mycorhiziens) peuvent limiter les émissions de N₂O du sol.
Cet article donne une nouvelle vision sur le rôle des champignons dans les émissions des GES du sol. En effet, comme le montre l'article de Maeda et al., 2015, les champignons peuvent produire du N₂O, et l'émission de N₂O est d'ailleurs un trait répandu chez de nombreuses espèces de champignons. Cet article apporte un nouvel éclairage car il montre que l'émission de gaz à effet de serre par les champignons n'est pas généralisable et que le groupe très abondant et répandu des champignons mycorhiziens arbusculaires peut au contraire participer à limiter les émissions de gaz à effet de serre du sol. Les auteurs recommandent de réaliser d'autres études afin de mieux connaître les mécanismes par lesquels les CMA limitent les émissions de N₂O.

Cet article porte à se questionner sur les nouvelles pratiques agricoles. En effet, les CMA sont moins abondantes dans les cultures intensives et lorsque les champs sont abondamment fertilisés. Or, si l'abondance des CMA diminuent dans ces parcelles agricoles, les émissions de N₂O augmentent.

Les émissions de gaz à effet de serre (GES) ont augmentés depuis 1850 (révolution industrielle) qui correspond aux activitées anthropiques: agriculture, développement industriel et expansion urbaine. Ce qui a contribué à perturber les cycles C et N des écosystèmes terrestres. La contribution des sols agricoles aux émissions de CO2, N2O et CH4 dépend des processus biophysiques et de l'incorporation/décomposition des résidus organiques dans le sol. Les conditions aérobies du sol produisent du CO2, tandis que les conditions anaérobies produisent du CH4, et les processus de nitrification et de dénitrification de l'azote minéral produisent des émissions de N2O.
Les sources naturelles de CO2 correspondent essentiellement au processus de respiration des organismes terrestres et aquatiques. On estime que 60 Pg C yr-1 (1 Pg = 1 x 1015 g) sont émis dans l'atmosphère par respiration autotrophe et qu'une quantité similaire est émise par respiration hétérotrophe (Reay et Grace, 2007)
Les sols du monde peuvent agir comme puits ou sources d'émissions de GES, et l'équilibre net entre l'absorbance du C atmosphérique et son rejet détermine l'état temporel net des sols en tant qu'absorbeurs de C (intrants) ou diffuseurs (extrants). Les sols contiennent au total environ 2500 Pg C, soit 3,3 fois la masse atmosphérique (Lal, 2006)
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En cours...

Cette revue replace le contexte global pour comprendre et étudier les émissions de gaz à effet de serre.

La contribution directe de la faune du sol dans la décomposition de la matière organique et la minéralisation des nutriments est faible comparée à celle des microorganismes. Cependant, la faune du sol, dont les nématodes et les vers de terre font partie, peut de part son activité modifier la densité, la diversité et la structure du microbiote du sol en exerçant notamment une pression de prédation (des nématodes se nourrissent de bactéries) et en modifiant des propriétés physico-chimiques du sol. Théoriquement, puisque les vers de terre et les nématodes peuvent affecter les communautés de microorganismes décomposeurs, ils sont considérés comme des facteurs pouvant affecter les émissions de CO₂ et de N₂O. Les auteurs se sont ainsi intéressés à évaluer l'impact des nématodes sur les émissions de gaz à effet de serre (GES) du sol ainsi que l'impact combiné de l'activité des nématodes et des vers de terre.

Les expériences ont été réalisées en microcosme pour évaluer l'impact des nématodes et des vers de terre sur les émissions de GES CO₂ et N₂O. Un sol sableux alluvionnaire a été collecté. L'abondance en nématodes a été mesurée, et la macrofaune a été retirée. Un protocole permettant d'augmenter ou diminuer la quantité de nématodes dans le sol prélevé a été réalisé. Les vers de terre épigé Eisenia foetida ont été utilisés.
5 traitements ont été réalisés (80 g de terre dans chaque microcosme) :

• Sans nématodes
• Dense population de nématodes (45 individus/g de sol) sans vers de terre
• Dense population de nématodes + 2 vers de terre
• Faible population de nématodes (15 individus/g de sol) sans vers de terre
• Faible population de nématodes + 2 vers de terre 5 réplicats sont réalisés pour chaque traitement (soit 25 microcosmes). Les émissions de GES ont été déterminées en mesurant 1 fois tous les 2 jours pendant 15 jours les concentrations en CO₂ et N₂O grâce à un chromatographe en phase gazeuse.

Les émissions de gaz à effets de serre sont plus importantes lorsque les populations de nématodes et de vers de terre sont plus grandes.
Les émissions de CO₂ et de N₂O sont respectivement 4,3 et 1,8 fois plus importantes dans le traitement avec une dense population de nématodes par rapport à celui sans nématodes.
Les émissions de CO₂ et de N₂O sont respectivement 5,2 et 2,7 fois plus importantes dans le traitement avec une dense population de nématodes + vers de terre.
Les émissions de CO₂ et de N₂O sont respectivement 19% et 21% plus importantes dans le traitement avec une dense population de nématodes comparé au traitement avec une faible population de nématodes.
Les émissions de CO₂ et de N₂O est respectivement 12% et 27% plus importantes dans le traitement avec une dense population de nématodes + vers de terre comparé au traitement avec une faible population de nématodes + vers de terres.
Une corrélation positive entre les émissions de CO₂ et de N₂O a été constatée.

La méthode est bien expliquée et me semble rigoureuse.
Cependant, tout comme dans de nombreuses autres études et comme l'indiquent les auteurs eux-même dans la partie discussion de l'article, le système de microcosme utilisé est trop simple comparé à la réalité : les communautés réelles de faune du sol sont composées d'une plus importante diversité d'espèces et ont une structure plus complexe. Une seule espèce de vers de terre épigés a été étudiée et l'influence des vers de terre des catégories écologiques endogés et anéciques n'est pas considérée. De plus, il s'agit d'une étude à court terme et les expériences ont étaient réalisées sur un seul type de sol (sol alluvionnaire sableux). Pour ces raisons, les résultats sont à prendre avec précaution et il ne faut pas les généraliser. Les auteurs suggèrent de réaliser de nouvelles études dont des études de terrain à long terme pour mieux connaître le rôle des microorganismes et de la faune du sol dans les émissions de gaz à effets de serre.

Cet article soutient que l'activité des nématodes et l'effet combiné des nématodes et des vers de terre font augmenter les émissions de gaz à effets de serre du sol CO₂ et N₂O.

L'apport en carbone provient principalement de la litière de feuilles, de la litière de racines et des exsudats de racines. Environ 85 à 90 % de la décomposition des matières organiques (MO) dans le sol se fait par voie microbienne et environ 10 à 15 % de l'énergie produite est utilisée par la faune du sol.
La revu montre que les organismes du sol ont des préférences pour différents substrats et se localisent dans différents espaces pédologiques.
La localisation des microorganismes a montré qu'elle n'était pas en adéquation avec la disponibilité en substrat C.
Les champignons assimilent le C directement de la couche de litière, tandis que les bactéries absorbent les substrats du sol sous la litière. L'étendue et l'intensité de la zone active de décomposition bactérienne sont directement liées au transport du soluté par diffusion et convection. L'augmentation de la teneur en eau accélère le transport des substrats solubles, ce qui entraîne une augmentation de la biomasse et de l'activité microbienne, tout en entraînant un épuisement plus rapide des substrats pour la croissance et l'activité microbiennes après la phase initiale. Il semble donc que la décomposition bactérienne des substrats à faible poids moléculaire dépendent de l'efficacité de l'échelle microscopique transport à proximité des populations bactériennes.
Les organismes autotrophes utilisent l'énergie obtenue de la lumière ou de composés inorganiques pour réduire le CO₂ et synthétiser la MO. Bien que d'autres voies métaboliques existent, le cycle de Calvin est de loin la voie de fixation du CO₂ la plus abondante avec la ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygénase (Rubisco) comme enzyme fixant le CO₂. Outre les organismes eucaryotes photosynthétiques, de nombreux procaryotes se sont également fiés au cycle de Calvin pour la fixation du CO₂, et de nombreux autres ont au moins hébergé Rubisco. Une riche diversité fonctionnelle de gènes Rubisco a été trouvée dans le sol, ce qui indique qu'un large éventail de bactéries du sol capable de fixation autotrophe du CO₂.

Dans une de leur expérience, ils montrent que la faune du sol a dégradé de façon préférentielle les bassins de carbone chimiquement et physiquement les plus stables dans une expérience en microcosme où le sol a été inoculé avec des vers de terre, des enchytraeids, des collemboles et des nématodes.

La dégradation de la matière organique se fait de façon préférentielle par les micro organismes (bactérie et champignons) selon le substrats : composition des sols. Donc la composition des sols (biotique et abiotique) joue un rôle sur les mécanismes de dégradation de la matière organique.

Les sols sont les principales sources du gaz à effet de serre oxyde nitreux (N₂O). L'émission de N₂O à la surface du sol est le résultat de processus de production et de consommation. Jusqu'à présent, la recherche s'est concentrée sur la production nette de N₂O. Cependant, dans la littérature, de nombreux rapports font état de flux négatifs nets de N₂O (c'est-à-dire de flux de N₂O de l'atmosphère vers le sol). Ces flux sont fréquents et substantiels et ne peuvent pas être simplement considérés comme du bruit expérimental. La consommation nette de N₂O a été mesurée dans diverses conditions.

Le taux d'absorption du N₂O (réduction à N₂ plus absorption par l'eau) dépend principalement des propriétés du sol, telles que la disponibilité de N minéral (substrat pour la nitrification et la dénitrification), la teneur en oxygène et en eau du sol, la température du sol, le pH et les conditions redox et la disponibilité de C et N organique labile. Les diverses conditions stimulant l'absorption du N₂O, dont l'énigme d'absorption dans un sol sec, donnent des indications concernant divers processus responsables de cette absorption.
Une faible teneur en azote minéral et un taux d'humidité élevé favorisent la consommation de N₂O. Ceci s'inscrit dans le cadre de la dénitrification en tant que procédé responsable, réduisant ainsi le N₂O en N₂. Il a également été signalé que les nitrifiants consomment du N₂O dans la dénitrification des nitrifiants. La contribution de divers procédés pourrait expliquer le large éventail de conditions permettant la consommation de N2O, allant de températures basses à élevées, de sols humides à secs, et de parcelles fertilisées à non fertilisées.

Il faut davantage de recherche axée sur les processus pour comprendre comment les variables du sol interagissent pour contrôler l'absorption de N₂O dans les sols. Il est suggéré que l'absorption de N₂O est souvent masquée par une plus grande production de N₂O et pourrait, par conséquent, être plus importante qu'on ne l'a supposé jusqu'ici.

Une méthode non intrusive doit encore être trouvée pour quantifier clairement l'absorption brut de N₂O in situ. Comme l'ont souligné plusieurs auteurs cités dans la présente étude et le GIEC, les sols pourraient devoir être considérés comme un puits supplémentaire, en plus de la destruction du N₂O stratosphérique. Il convient toutefois de souligner que la base de données des études sur le terrain et en laboratoire doit encore être élargie avant de pouvoir tirer des conclusions définitives quant à l'ampleur de ce puits supplémentaire possible et à sa contribution au budget mondial de N₂O.

Les conditions interférant avec la diffusion du N₂O dans le sol semblent augmenter la consommation de N₂O. Les facteurs régulant la consommation de N₂O ne sont cependant pas encore bien compris et méritent une étude plus approfondie. Une étude systématique de la consommation de N₂O est donc nécessaire. Elle devrait se concentrer sur les organismes, réactions et facteurs environnementaux en cause.

L'article s'intéresse à différents types de sols de différents pays, en zones tropicales et tempérées. Elle se veut être la plus représentative possible de la dynamique globale du N₂O dans les sols, en lien avec la disponibilité en eau et nutriments, la température et l'activité biologique.

La teneur et la forme de l’azote minéral contenu dans le sol exercent un effet important sur la nature et l’intensité des émissions de N2O. Les bactéries dénitrifiantes utilise NO3-, NO2- et/ou N2O comme accepteurs d’électrons en absence de O2. La dénitrification se caractérise par une dépendance de la vitesse aux faibles concentrations en NO3- et une indépendance aux plus fortes teneurs.

Cette thèse met en évidence l'effet de la pression en O2 sur l’activité nitrifiante ainsi que sur les émissions de N2O par nitrification. La compréhension des processus facilitera l’étude des mécanismes d'émissions de N2O par nitrification ainsi que l’effet de O2 sur ces émissions. Elle devrait permettre d'améliorer les modèles de prévision des émissions de N2O. L’absence de C2H2, dans la réaction de dénitrification, favoriserait la réduction de N2O en N2 et par conséquent minimiser la production de N2O pendant la phase aérobie après la pré-incubation anaérobie.

Explique les processus de nitrification et de dénitrification microbiens et la production de N2O selon le milieux.

L'agrégation des sols a une grande influence sur les caractéristiques physiques du sol. Les sols bien agrégés possèdent un plus grand espace poreux, un taux d'infiltration plus élevé et un meilleur échange gazeux entre le sol et l'atmosphère que les sols mal agrégés, ce qui entraîne une activité microbienne accrue. La préservation de la matière organique (MO) est souhaitable pour les terres
puisqu'elle est largement reconnue comme un élément clé du cycle des éléments nutritifs.
Les vers de terre jouent un rôle dans le processus de la formation de ces liants contribuant à l’agrégation des sols.
Toutefois, la capacité de protection du C par ces microagrégat nouvellement formés n'a pas été étudiée. L'objectif est d'étudier les effets des vers de terre sur la formation de macro- et microagrégats dans le sol et la protection du C à une échelle microagrégat à l'intérieur de leurs excréments appelés turricules.

Les auteurs ont utilisés des feuilles de sorgho marquées au 13C pour suivre l'incorporation de résidus nouvellement ajoutés dans différentes fractions de C associées aux agrégats. Les taux de minéralisation en carbone des agrégats intactes formés et des agrégats concassés ont été déterminés pour évaluer le degré de protection de C contre la décomposition dans les différentes classes de taille d'agrégats.

Les vers de terre favorisent la formation de macroagrégats et augmentent la circonférence de ces derniers.
Pas de changement sur la respiration.
Le total de C et de 13C est fortement influencé par l'activité des vers de terre. Dans les grands macroaggrégats, le C et le 13C totaux étaient significativement plus élevés en présence de vers de terre. Il n'y avait pas de différences significatives entre le C total et le 13C dans les petits macroagrégats.

La proportion de C protégé dans les microagrégats était plus élevée en présence de vers de terre (x2.5).
Plus de C non protégé dans les microagrégats sans vers.
La quantité de C13 dans les microagrégats dans les macroagrégats était importante en présence de vers de terre mais sans vers de terre n'a eu aucun effet sur le stock protégé de 13C.

Seulement 4 réplicats
Contrôle biologique et négatif
Utilisation statistique : ANOVA

Les vers de terre ont une influence positive sur la stabilité des agrégats du sol qui stock (protège) une partie importante de C du sol.

Toutes les catégories écologiques (anécique, épigé, endogé) de vers de terre ne sont pas prises en compte. Les plantes ne sont pas non plus pris en compte.

• Trois méthodes principales ont été utilisées pour distinguer la respiration hétérotrophe de la respiration autotrophe du sol :
o L’intégration des composantes contribuant à l'apport de CO₂ dans le sol forestier in situ (litière, racines, sol)
o La comparaison des sols avec et sans exclusion des racines
o L'application de méthodes isotopiques stables ou radioactives
• La respiration des racines et de la rhizosphère peut représenter aussi peu que 10 % à plus de 90 % de la respiration totale in situ du sol, selon le type de végétation et la saison de l'année.
• Le pourcentage de contribution des racines à la respiration totale du sol tout au long d'une année entière ou d'une saison de croissance montrent des valeurs moyennes de 45,8 et 60,4 % pour la végétation forestière et non forestière, respectivement.
o La contribution des racines à la respiration totale du sol est généralement plus élevée pendant la saison de croissance et plus faible pendant les périodes de dormance de l'année.

Les auteurs semblent avoir clairement identifiés les limites de leur review. La dynamique de séquestration/émission de CO₂ est de fait fortement reliée aux paramètres biotiques et abiotiques des écosystèmes. La non prise en compte de ces derniers constitue un biais important pouvant remettre en question la fiabilité des résultats obtenus. La non-détermination et prise en compte des groupes fonctionnels présents dans chaque écosystèmes influe également en se sens.

Des études comparatives sur l'intégration des composants, l'exclusion des racines et les approches isotopiques pour séparer la respiration radiculaire de l’apport total de CO₂ sont cruellement nécessaires, mais malheureusement très rares. Quelle que soit la méthode choisie, les études futures doivent comporter des mesures répétées tout au long d'un cycle annuel afin de déterminer adéquatement les variations saisonnières dues à l'évolution des tendances de l'activité des racines souterraines.

La contribution racinaire constitue une part non négligeable de l'apport total de CO₂ aux émissions de gazes à effets de serres. Cette dernière est intimement reliée à l'activité des organismes du sol en relation trophique avec le cortège racinaire. Elle doit donc être prise en compte pour établir des bilans d'émissions et de séquestrations de carbone.

La review s'intéresse en majorité à des études portant sur les écosystèmes forestiers, par des approches de terrain. Elle comporte une sous-représentation de la diversité des écosystèmes, de par le choix de catégorisation qui à été fait par les auteurs. Les études des systèmes non-forestiers ne permettent par exemple pas d'évaluer la contribution racinaire à l'apport total de CO₂ dans les agrosystèmes. Cette distinction permettrait de mettre plus clairement en évidence les contributions des différents types d'écosystèmes et si possible en lien avec les paramètres abiotiques des milieux (type de sol, température, humidité, etc.). Il faut cependant que le nombre d'étude disponible permette une telle distinction.